随着知识经济时代的到来,以及“创新型国家”战略实施的要求,构建具有竞争力和自身优势的区域创新系统,已经成为未来区域经济发展的重要动力来源。在区域创新体系之中,高新技术产业作为创新的主要阵地,在整个区域创新能力提升过程中,扮演着不可或缺的重要角色。此外,随着自主创新对创新资源需求越来越大,单个创新主体自身独立创新的难度也越来越大,因此协同创新对于创新系统中的各个创新主体来说,无疑是解决创新资源有效配置问题的最有效方式。所以,对于区域高新技术产业协同创新能力的评价研究,对于区域乃至国家未来的创新战略都有着十分重要的意义。本文首先对国内外关于区域高新技术产业协同创新能力的相关研究进行了回顾整理,发现目前的研究主要从区域创新资源的投入产出来评价创新能力,缺乏系统的结合协同环境等影响因素来对创新能力综合评价,这为本文提供了研究思路。然后在综合文献分析的基础上,本文从主体环境、协同环境、协同绩效三个维度构建了区域高新技术产业协同创新能力评价指标体系。并利用结构方程对指标体系进行验证,利用Amos软件绘制结构方程图,进一步诠释区域高新技术产业协同创新系统内部运行机制。进而结合统计数据,利用主因子分析法对全国31个省份的区域高新技术产业协同创新能力进行评价分析,在此基础之上,利用聚类分析法进行归类。最后从协同环境和协同绩效两个角度分别进行主因子分析,并对协同度进行回归关联性分析,然后利用聚类分析,得出区域高新技术产业协同创新能力矩阵分布图。在前文分析基础上,针对区域高新技术产业协同创新能力中的不足之处,结合区域实际情况,提出针对性政策建议。