利用基因芯片及磁分离技术对苏北地区胃癌单核苷酸多态性易感性研究

来源 :东南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:YOOOZHANG
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
我国的胃癌发病率和死亡率均居各类肿瘤之首,是世界上胃癌发病率和死亡率最高的国家之一。胃癌的发生是遗传和环境因素共同作用的结果,个体遗传特性决定对肿瘤的易感性,早发现是改善疗效、提高胃癌患者生存率的关键。因此,深入进行胃癌病因学和发病机制研究,寻找和确定相关分子标志物和易感因素,筛选高危人群以采取有效的预防控制和治疗措施具有重要意义。SNP是人类基因组中最常见的变异,具有数量多、分布广、易于快速检测、便于分型等特点。根据“常见疾病,常见变异”理论,在胃癌病例人群和正常对照人群中进行SNP分型对比研究,可以确定SNP位点或其邻近变异与肿瘤发病风险的关系,从而可应用于肿瘤遗传易感性的研究。  本文在前人研究的基础上,首先制备了γ-Fe2O3磁性纳米粒子,并修饰亲和素,同时对研究样本进行DNA提取,扩增出含有待检测SNP位点的PCR产物,然后利用基于磁性纳米粒子和双色荧光杂交的SNP分型方法对大量样本进行分型。该方法充分将双色荧光探针杂交技术、生物芯片的高通量“并行”读出技术、以及磁性纳米粒子易于实现分离、富集的功能相结合,实现了对大量样本的低成本、高效率、高准确性分型。利用此方法对苏北地区人群118个胃癌病例和120个正常对照的COX-2基因启动子区-765G>C多态位点和BCL-2基因-938C>A多态位点进行SNP分型,最后采用SPSS13.0进行统计分析,应用X2检验和非条件Logistic回归模型计算OR(odds ratio)和95%CI(Confidenceinterval)对分型结果进行病例.对照研究,得到如下结论:  1、在胃癌病例组和正常对照组中COX-2基因-765G>C位点和BCL-2基因-938C>A位点的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律,选取样本具有群体代表性,可以代表苏北地区人群。  2、与COX-2基因-765GG型比较,带有COX-2基因-765GC+CC基因型的个体在胃癌组中显著增高,OR值为1.808(95%CI:1.050~3.113,P=0.033),即个体携带-765GC或CC基因型能显著增高胃癌的发病风险,C等位基因与苏北地区人群胃癌易感性增高相关。  3、单独携带BCL-2-938CC基因型的个体患胃癌的风险是携带AA基因型个体的3.185倍,这表明在同等外在条件下,携带CC基因型的个体更容易患胃癌,且随着C等位基因的增加,OR值上升趋势明显,提示BCL-2基因-938C>A位点的多态性与胃癌的遗传易感性呈等位基因计量-效应关系。  4、深入研究表明:COX=2-765CC和COX-2-765GC分别与BCL-2-938CC基因型在胃癌的发病风险中存在着明显的加乘交互效应,与COX-2-765GG和BCL-2-938AA基因型携带者相比,其胃癌的发病风险明显增高,OR值分别为10(95%CI:1.280~78.117,P=0.028<0.05)和4.667(95%CI:1.137~19.154,P=0.0325<0.05),统计学差异显著,说明COX-2基因和BCL-2基因在胃癌的发生中有明显的协同作用。
其他文献
该文通过理论分析、数值计算和实验研究三种方法对空气横掠椭圆管的换热及流动特性进行了研究.利用边界层积分方程近似方法,分析了层流状态下绕流椭圆管的边界层发展状况,讨
尼非韦罗(Nifeviroc)是具有中国自主知识产权的抗艾滋病药物,药效研究显示其体外抗HIV活性强,对阴道黏膜没有刺激性,具有广阔的应用前景,但其存在水溶性差的特点,需要制备合适的药
泄爆是指通过泄爆装置将腔室或容器内已燃高压混合气体导入到外部环境中,使内部压力迅速降低以防爆炸的技术。本文采用数值模拟的方法,对泄爆过程进行了研究。 首先,简要介绍
该文涉及半干法烟气脱硫技术,对双循环流化床烟气脱硫技术进行了进一步的研究.目的是深入探索半干法烟气脱硫的机理,力图掌握半干法脱硫反应的实际过程,以寻求优化、简化半干
论文对不同的预测需求提出了不同的预测模型。短期负荷预测需要预测出将来某一段时间(不超过一年)内,每天的最高、最低负荷,它主要是用来进行整个电网的安全性分析。所以对于短期
近年来随着电力工业的迅速发展,汽轮发电机组不断向自动化、高参数的方向发展,对汽轮发电机组在线状态监测和故障诊断技术提出了更高的要求,伴随着网络技术、数据库技术的不
学位
往复脉缩机是石化生产流程中最常见也最为重要的设备,通常用于驱动气体或者给气体增压来满足工艺流程的需要。由于往复压缩机活塞间歇性的往复运动,导致管道中气体也存在一定的脉动,脉动的气体遇到管道中结构变化处会形成激振力,从而引起管道的振动。振动过大会影响企业的正常生产,更有甚者会导致支撑断裂或管道泄漏等重大事故。研究气流脉动具有非常重要的实用价值。导管架平台是我国开采海洋资源的必然途径和工具,由于其结构
我国非道路柴油机第三阶段排放标准对小功率段柴油机的排放要求甚为严格。我国小功率柴油机主要机型是单缸柴油机,但目前国内外对单缸水冷直喷柴油机的低排放研究较少,因此开
质谱技术具有高通量,高灵敏度和能进行分子结构鉴定和分析的特点,被广泛的应用于生物分子的分析中。而循环肿瘤细胞的研究,对于肿瘤的预防、诊断和个性化治疗具有至关重要的作用。目前针对循环肿瘤细胞的主要分析方法是蛋白分析方法和基因分析方法。而对于循环肿瘤细胞的代谢研究,目前仍缺少耦合的平台与技术来较好的分析其代谢分子。随着材料技术的发展,其在质谱技术和循环肿瘤细胞的检测分析中扮演着重要的角色,但在表面化学