细胞质膜介导细胞与外界环境以及细胞与细胞之间的物质交换、能量转换和信号传递。细胞质膜微区是细胞质膜中富含鞘脂和胆固醇的膜微畴结构，参与细胞内外物质交流、细胞信号传导等重要的细胞生命活动。质膜蛋白质在药物研究中有重大意义。 本论文研究分为两个部分，第一部分为大鼠肝脏低丰度整合质膜蛋白质组学研究。肝脏是人体中最重要的器官之一，在代谢中扮演着重要的角色，因此肝脏质膜蛋白质组的研究具有重要意义。低丰度、强疏水性膜蛋白质的鉴定仍然是质膜蛋白质组研究的主要挑战，这部分工作采用两次密度梯度离心法纯化大鼠肝脏质膜，电镜和免疫印迹显示，与一次超离相比，质膜富集了6倍。收集质膜采用Na<,2>CO<,3>处理，氯仿与甲醇抽提，以及Triton X-100处理后进行超离以分离出微区的三个组分。共鉴定了457个非冗余蛋白质，46％来自微区提取策略，23％具有一个或一个以上的跨膜区(TM)，53个蛋白质与细胞通信有关。研究结果表明：Na<,2>CO<,3>处理膜有利于碱性蛋白质研究，氯仿与甲醇的使用有利于多跨膜区蛋白质研究，微区提取策略有利于低丰度蛋白质研究。 第二部分为衰老过程中小鼠大脑皮质质膜微区的比较蛋白质组学初步分析。大脑皮质是中枢神经系统最复杂的部位，是人类的最高神经中枢。大脑皮质细胞进行着频繁的信号传导和物质交换过程，其细胞质膜微区在这些活动中起到了重要作用。衰老是生命的基本过程，脑功能退化是衰老的重要方面，因此，衰老过程中大脑皮质质膜微区的比较蛋白质组学研究具有重要意义。本部分工作对D-半乳糖亚急性衰老模型小鼠和正常小鼠的大脑皮质质膜微区蛋白质进行了比较蛋白质组学初步分析。采用去垢剂处理和蔗糖密度梯度离心方法得到纯化的质膜微区蛋白质，经免疫印迹检验显示微区蛋白得到了富集且降低了其他细胞器的污染。采用双向电泳和软件分析得到了造模组和对照组微区蛋白质组的78个差异蛋白质点，经质谱鉴定了36个蛋白质，其中19个蛋白质在造模组中是上调的，17个是下调的。在上调的差异蛋白质中，多为糖代谢和生物氧化作用过程中起重要作用的酶及应激蛋白质，在下调的蛋白质中，多为离子通道蛋白、神经突触蛋白质、信号传导相关蛋白质及细胞分裂相关蛋白质，这些结果与衰老模型发生发展机制和造模后产生的衰老体征是一致的。