5号染色体长臂食管鳞癌相关基因的初步筛选

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为了探索5号染色体长臂上可能存在的抑癌基因,我们通过微卫星杂合性丢失和基因mRNA表达研究对该区域的食管癌抑癌基因进行初步筛选.目的1、寻找5号染色体长臂上的微小缺失区域,为筛选食管癌抑癌基因缩小范围.2、通过基因mRNA表达分析和基因内微卫星标记的杂合性丢失研究,对缺失区域附近可能存在的候选抑癌基因进行初步筛选.3、寻找与食管癌临床病理参数相关的微卫星标记.材料与方法1、采用PCR银染方法,检测50例食管鳞癌标本5号染色体长臂区域15个微卫星标记的杂合性丢失频率.2、采用RT-PCR技术研究23例食管鳞癌标本HSD17B4基因mRNA的表达情况,并检测该基因内微卫星标记D5S1384的杂合性丢失频率.结论1、在5号染色体长臂上发现了一个从未报道的新的食管鳞癌缺失区域,位于5q23.1-23.2(D5S1384-D5S1505),共272kb.2、该区域内HSD17B4基因在mRNA水平明显下调,基因内标记D5S1384杂合性丢失频率较高,提示HSD17B4基因是候选的食管鳞癌相关基因.3、D5S2501、D5S820、D5S1456和D5S408位点杂合性丢失率较高,其附近区域可能存在食管鳞癌相关基因.4、D5S820可能与食管鳞癌细胞分级相关,而D5S408可能与食管鳞癌淋巴结转移相关.
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