河流是重要的自然生态系统，为人类提供了多种多样的生态服务。随着人口数目增长和经济的迅速发展，河流生态环境受到严重影响，河流生态系统功能退化，河流生态系统健康与河流可持续管理己经成为国际广泛关注的核心问题之一。河流生态系统健康作为管理河流崭新的评估工具和技术手段，已经成为生态学、环境科学和水利科学交叉研究的焦点。　　本文采用理论与实践相结合的方法，对河流健康评价指标体系的构建与评价方法进行研究。在综合国内外河流健康概念和内涵的基础上，构建了基于物理因子、水质因子、生物因子、功能因子四个维度44个指标的模型假设，以辽河保护区为例，通过资料收集、遥感解译、野外现场监测的方法获得指标数据，运用正态分布、齐性检验、信度和效度四种数学方法对评价指标进行筛选分析；通过运用结构方程模型法进行模型参数估计、模型拟合检验及模型修正，构建了基于河流生物与功能的河流健康评价模型，对辽河保护区生态系统健康状况进行评价。主要研究结果如下：　　保护区河流整体处于比较健康的状态。研究区58.8％采样断面属于健康等级，断面包括:福德店、三河下拉、通江口、双安桥、菜牛、凡河口、石佛寺水库、马虎山、巨流河、曙光大桥；41.2%断面处于亚健康等级，断面包括：哈大高铁橡胶坝、毓宝台、满都户、红庙子、达牛、大张桥和曙光大桥。　　本论文的研究可以为辽河保护区和国内其他地区的河流生态系统健康评价提供理论基础和可操作的技术方法，评价结果对指导保护河流健康状况的实践活动具有重要现实意义。有关部门需要采取正确的方式和对策对河流进行合理的管制和规划，尽量消除或减少影响河流健康的制约因子，使河流朝着健康、良好有序的方向发展，进而提升河流对人类社会的服务功能。