本研究利用29个微卫星座位多态性分析了中国农业科学院家禽研究所国家地方禽种资源基因库保种的鹿苑鸡、固始鸡、藏鸡、白耳鸡、仙居鸡、茶花鸡、大骨鸡、北京油鸡、狼山鸡、河南斗鸡、丝羽乌骨鸡和萧山鸡等12个地方鸡品种的等位基因频率、所有座位的Hardy-Weinberg平衡以及群体间的遗传变异,并通过Dc遗传距离构建NJ和UPGMA一致树分析群体间的亲缘关系;此外还初步探讨了29个微卫星标记与鹿苑鸡体重、体尺以及公鸡的屠宰性能和肉品质性状、母鸡产蛋性能间的相关性。研究结果如下: 1.在12个中国地方鸡品种中,29个微卫星座位均表现多态,共发现了228个等位基因。其中,在LEI234微卫星座位上检测到的等位基因最多,为23个;在MCW103和MCW098微卫星座位上检测到的等位基因最少,只有两个。平均每个座位上的等位基因数为7.86±5.19个。12个地方鸡品种的平均观察杂合度为0.4471,平均期望杂合度为0.5453。 2.对所有座位进行Hardy-Weinberg平衡检验,结果表明,除北京油鸡、鹿苑鸡、狼山鸡和茶花鸡以外的8个中国地方鸡品种在整体上都处于Hardy-Weinberg平衡状态;鹿苑鸡和茶花鸡偏离Hardy-Weinberg平衡,表现为显著的杂合子缺失;北京油鸡和狼山鸡表现为显著的杂合子剩余。 3.12个中国地方鸡品种间两两分化显著,总体上,在总变异中,16.6%属于品种间的变异。经Friedman检验,群体间分化程度的三种估计量θ、G_ST和ρST之间无显著差异。