本研究以贵州都匀马尾松种子园收集区和子代测定林马尾松为材料,对马尾松树高、胸径、冠幅等生长性状和材性性状进行研究,利用主成分分析和综合指数法对马尾松二代育种亲本进行选择,并利用ISSR-PCR对初步筛选出的亲本进行遗传多样性分析和指纹图谱的构建,本文研究结果如下:1.马尾松雌雄花的空间分布具有明显的成层性,大部分雌花(78%)分布于树冠的中上层,大部分雄花(89%)分布于树冠中下层,且不同无性系间雌雄花量差异较大,雌雄花比例为2:3,在个别无性系中,存在着明显的偏雌偏雄现象。2.马尾松树高、胸径、冠幅、分枝角、雌雄花量等生长性状在无性系间变异系数大,性状差异明显,冠幅、分枝角、雌雄花量等性状受中等以上强度的遗传力控制(遗传力>0.5),树高和胸径受遗传力控制的强度较弱,马尾松树高、胸径与冠幅间,一级分枝数与花量间呈极显著正相关,雌花与冠幅、雄花呈负相关关系,但相关性不显著。3.利用主成分分析法构建了马尾松生长性状的综合评价方程:,利用综合指数法构建了生长性状的等权重无约束指数方程为:,通过两种方法从收集区98个无性系中选出28个生长性状优良的无性系作为二代种子园候选亲本。4.对马尾松种子园子代测定林48个半同胞家系木材基本密度、1%Na OH抽提物含量、纤维素和木质素含量和遗传变异进行分析,结果表明:木材基本密度、1%Na OH抽提物含量、纤维素和木质素含量变异来源于家系间;马尾松的胸径与树高呈极显著正相关,而胸径与基本密度、树高与1%Na OH抽提物呈极显著负相关,树高与基本密度呈显著负相关,纤维素含量与木质素含量呈负相关,但相关性不显著。5.利用综合指数法构建了马尾松生长与材性性状的等权重无约束指数方程:,强调生长性状的指数方程:,强调生长与基本密度的指数方程:,强调生长与材质的指数方程为:,并利用4个指数方程从子代测定林48个家系中选出20个生长与材性兼优的家系作为二代种子园的候选亲本。6.利用ISSR分子标记对初步筛选出的亲本进行遗传多样性分析发现:经过筛选后建园亲本遗传指数有所下降,但下降幅度不大,利用UPGMA聚类法对二代种子园建园亲本的亲缘关系进行聚类分析,亲本间遗传距离小,相似度高、遗传关系较近,因此同时利用了引物807和引物900两个引物才能将所有亲本一一鉴别开来,并构建了马尾松二代育种亲本的指纹图谱。