动物乳腺生物反应器是指利用乳蛋白基因的调控元件构建表达载体,使外源蛋白在乳腺组织中特异表达并分泌至乳汁中,通过收集乳汁经纯化获得重组蛋白的一种表达系统。由于动物乳腺生物反应器可用于大量表达多种具有天然活性的结构复杂的治疗性重组药用蛋白,比目前采用发酵法和哺乳细胞培养法生产药用蛋白的生产方式节省了大量的成本和能源,因此具有明显的竞争优势。然而来源于人类不同组织中不同种类的重组人蛋白在动物乳腺生物反应器中的表达水平存在着巨大的差别,这极大地限制了动物乳腺生物反应器的广泛应用。因此为了探究哺乳动物组织特异性的密码子使用方式是否是影响动物乳腺生物反应器的一个重要因素,本研究系统比较了人类和小鼠中乳腺组织特异性表达基因和其他六种组织中特异性表达基因之间密码子使用方式的差异,同时还比较了乳腺组织特异性表达基因与动物乳腺生物反应器中成功表达的重组人蛋白基因之间的密码子使用特点差异。比较结果表明人类和小鼠的乳腺组织的密码子使用方式与个别其他组织存存较大差异,但与大多数其他组织差异不显著；动物乳腺生物反应器中重组人蛋白的表达水平与其密码使用特征不存在显著的相关性。　　 进一步对动物乳腺生物反应器表达的重组人蛋白和乳蛋白的核心结构域的三维结构进行分析之后,我们发现核心结构域与四种酪蛋白的核心结构域比较相似的重组人蛋白在动物乳腺生物反应器中往往具有较高的表达量。因此我们认为在转基因的转录水平得到较为一致的调控之下,蛋白三维结构可能比组织特异性的密码子使用方式更能影响动物乳腺生物反应器的表达水平。本研究为今后研制高效的动物乳腺生物反应器提供了有益的理论研究基础。