自改革开放以来,在中国广袤大地上设立了各式各样的政策功能区,比如开发区、高新区、保税区、自贸区等等。国家高新区是为了推动高新技术产业发展而设立的功能区,肩负着特殊使命、享受着特殊政策照顾。有着三十多年发展历史的国家高新区,在推动形成高新技术产业集聚规模效应,促进地方高新技术产业发展,成为地方经济发展强劲引擎的同时也在管理体制机制上创新也作了许多新实践新探索。作为高新区管理体制机制的集中反映,各地因地制宜设置高新区管理机构,呈现出多种多样的机构设置样式和形态。这些宝贵经验也为地区机构改革和体制机制创新带来全新启示。Y高新区是Y市唯一的国家级高新技术产业开发区,在完成市级、省级、国家级高新区的“三级跳”过程中探索尝试了一些机构设置方案,通过整合、融合、合并的方式,在机构设置未定型的情况下,确保了停留在“文件”层面上的管理主体—高新区管委会管理职能的发挥。本文主要围绕Y高新区管理机构设置问题展开,通过介绍高新区的基本情况,重点聚焦高新区机构设置情况,主要围绕Y高新区机构设置过程中存在的种种问题,运用组织理论、政府间关系理论、政府职能理论等理论工具,系统分析其中原因,参照先进地区高新区机构设置理念和经验做法,试图为完善和健全Y高新区机构设置提出可行性建议。本文共分为六个部分展开,第一部分阐述了高新区机构设置研究的背景和意义,对国内外学界对高新区机构设置研究情况进行了整理,并对文章中几个关键性概念进行了辨析,并介绍了研究理论视角和研究方法路径。第二部分对国内高新区机构设置的概况作了介绍,初步归纳了影响高新区机构设置的内外部因素。在宏观的背景之下,还以Y高新区作为小切口进行微观分析解剖,展现了Y高新区机构设置从过去到现在的动态图谱,进行横向和纵向的比较分析,发现并提出高新区机构设置从理论到实践等方面存在的诸多问题。第三部分着重分析高新区机构设置诸多问题,论证机构设置缺陷对高新区自身发展带来的不良后果,并着重从多方面为高新区机构设置行为逻辑提供合化理解释。第四部分着重探讨国外、国内、省内先进高新区在机构设置方面的机构是设置理念和科学设置方法,从理论层面为高新区机构设置方案提供方向性和原则性指导。第五部分在实际操作层面提供一些补充性建议,试图帮助Y高新区走出机构设置现实困境,继而为新生代国家级高新区机构设置提供借鉴。第六部分对全文的论述分析进行总结和概括,并对高新区的发展和机构设置优化完善进行展望。