【摘 要】
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首先运用相关的软件包CS Chemoffice SDK(Chemdraw,Chem3D),对样本EP0127902中的一系列高活性的噁唑烷酮类化合物的三维构象进行研究,建立了三维药效基团模型:噁唑烷酮环3-位
【出 处】
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中国协和医科大学 北京协和医学院 中国医学科学院 清华大学医学部
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首先运用相关的软件包CS Chemoffice SDK(Chemdraw,Chem3D),对样本EP0127902中的一系列高活性的噁唑烷酮类化合物的三维构象进行研究,建立了三维药效基团模型:噁唑烷酮环3-位苯环与噁唑烷酮环共平面或近似共平面,噁唑烷酮环5-位取代基在噁唑烷酮环平面的左前方的构型对抗菌活性有利,噁唑烷酮环上羰基氧原子作为氢键供体.初步推测了药物与受体相互作用的重要位点及其相互结合的假想模型.运用Accelrys Cerius 2软件包中的与药物设计相关的QSAR模块,采用比较分子力场分析方法(CoMFA)及偏最小二乘法(PLS),对样本EP0127902中的一系列活性各异的噁唑烷酮类化合物进行三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,建立了QSAR方程,可用于预测活性;通过CoMFA等势系数图分析得到化合物周围力场分布强弱对活性的影响,发现范德华力场的作用是主要的,而静电场的作用很小.从而使药物与受体相互作用假想模型更趋于合理,在此基础上进行基于受体的合理的药物设计.
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