共生菌和宿主长期共同生长、进化,在这种相互作用下,共生菌产生了许多结构多样和生物活性良好的次级代谢产物。本论文从昆虫和植物中分离优化筛选出四株共生真菌,对其次生代谢产物进行了一系列研究。利用TLC、硅胶柱、ODS反相柱、Sephadex LH-20、HPLC等多种色谱分离技术共分离得到23个化合物,利用多种波谱技术（HR-ESI-MS、1H NMR、13C NMR、HMQC、1H-1H COSY、HMBC、NOESY、CD、IR）以及单晶X-ray衍射等技术,鉴定了其中21个化合物的结构,其中新化合物4个,并进行了初步的抗菌和杀虫活性测定。具体结果如下:从点蜂缘蝽肠道中获得一株共生真菌IFB-A163,从其发酵产物中分离得到新环肽化合物（1）、异香豆素类化合物（2）和小柱孢酮类化合物（3）。对化合物1进行了抗菌活性和杀虫活性测试,结果表明,化合物1具有中等抗绿脓杆菌（Pseudomonas aeruginosa）活性（MIC为5.0 μM）,同时测得其对三龄褐飞虱Nilaparvatalugens的LD50为70 ng/虫。另外,从一株植物内生真菌分离得到9个已知杂环肽类化合物（4-12）在此一并描述,据报道,该类化合物具有抗疟疾、抗菌、抗癌等活性。从采自于峨眉山的棒络新妇（Nephila clavata L.Koch,1 878）共生真菌（IFB-46）的液体发酵产物中,分离得到五个吡啶酮生物碱类化合物（13-17）,其中有两个新化合物（14、17）。此外,对化合物（13、15）进行体外抗菌活性测定的结果表明,两化合物对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌分别有良好的抑制活性,MIC最低为2.0 μM;从二叶舞鹤草共生真菌（NF2128）的发酵产物中分离得到7个化合物,确定了其中四个化合物（18-21）的结构,这部分工作尚待进一步研究。此外,本文对天然活性环肽的研究进展作了综述。