RNase R在大肠杆菌的表达和条件优化

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近些年来,RNA研究领域特别是环状RNA算是目前生物医学研究领域的新兴热点方向之一,RNase R的活性直接影响其处理后环状RNA的质量,因此RNase R的生产和纯化值得深入的研究。核糖核酸外切酶R(RNase R)可降解几乎所有的线性RNA分子和Y结构RNA,但不易降解环形RNA(circRNA)、套索结构(lariat RNA)和3’突出末端少于7个核苷酸的双链RNA分子,因此可以构建内含子cDNA文库用于可变剪切研究。本研究从NCBI基因库找到了来源于大肠杆菌的核糖核酸酶R,从GDMCC购得含目的基因的菌株E.coli K12,提取基因组并以此为模板进行PCR,获得了目的基因。本研究的主要内容及结果如下:对目的基因rnr通过PCR进行扩增,并构建重组质粒pET22b-rnr;将重组质粒转入大肠杆菌BL21(DE3)中,筛选出重组大肠杆菌BL21(DE3)/pET22b-rnr。在LB培养基中对重组菌进行诱导以表达酶蛋白,通过SDS-PAGE分析其分子量大小。通过Ni柱亲和层析得到纯化的重组RNase R,并用酿酒酵母Total RNA作为底物进行酶活性测定,通过和RNase R(GESENEED公司)的对比实验表明本实验表达制备的RNase R酶活性接近或超过商业酶。由于不同条件下大肠杆菌外源蛋白表达量有较大差异,在已成功表达RNase R的基础上,本研究对重组大肠杆菌BL21(DE3)/pET22b-rnr进行表达条件的单因素优化实验,实验结果表明BL21(DE3)/pET22b-rnr的最佳诱导温度是20℃、最佳诱导点OD600是0.8、最适IPTG诱导剂量为0.8 mM、最适诱导时间为4h,此时目的蛋白可溶性表达量最高,达到了79.26 mg/L,较出发条件提高了54.7%。本研究还构建4种分子伴侣共表达菌(pGro7、pKJE7、pTf16和pG-Tf2,4种分子伴侣质粒分别与重组质粒pET22b-rnr共表达),筛选最适分子伴侣质粒,并优化共表达条件,提高目的蛋白可溶性表达。实验表明,分子伴侣质粒pGro7使蛋白表达量提高了43.80%,效果最为明显;20℃诱导时目的蛋白的可溶性表达最高;当L-阿拉伯糖浓度为0.50mg/mL时,蛋白表达量提高到了82.98 mg/L。通过分子伴侣共表达及优化表达条件提高了RNase R的可溶性表达水平,为该酶进一步应用奠定了基础。
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