图数据库中的子图查询算法研究

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图是计算机科学中的重要数据结构。随着信息技术地不断发展,出现了越来越多的以图作为逻辑表达的数据,例如化学分子结构式,生物网络,社会网络以及图像中的实体关系等等。另一方面,这些图数据本身的数据量也在不断增大,例如每天就有4,000个新的化学结构被加入到SCF Finder数据库;现在的社会网络图中的结点数目超过了1亿5千万。如何有效地管理和挖掘海量的图数据是图数据库研究的核心问题。具体包括:1)如何建立有效的存储机制和索引策略;2)如何有效地回答图数据库中的查询;3)如何从海量的图数据库中挖掘出有用的信息。子图查询是图数据管理中的基本操作。具体地说,给定一个查询图Q,在图数据库中找到所有包含查询图Q的数据图。由于子图同构是典型的NP完全问题,目前的子图查询算法均采用“过滤-精化”的算法来找到结果集。在过滤阶段,根据某种子图同构的必要条件过滤掉不可能包含查询图Q的数据图;然后在精化阶段利用子图同构算法在剩下的数据图中找到结果集。目前的大部分的过滤策略都是基于“特征子结构”(简称“特征”)的方法。这种方法没有考虑到特征之间的拓扑关系。根据特征和特征之间的拓扑关系,设计一种新的过滤策略将加快子图查询的响应时间。另外目前的子图查询算法没有考虑数据库频繁动态更新的情况。当数据库出现增删改时,不得不重新建立索引。为了适应动态的图数据库,根据图谱理论,将图的拓扑信息映射到数据空间中;并根据映射的数值空间,建立相应的索引结构。这种方法不但加快了过滤的时间,而且可以动态的维护索引结构。随着社会网络等复杂网络的出现,给定查询图Q,如何在一张大图中找到Q的匹配位置是非常有意义的课题,例如可以帮助我们找到社会网络中的特定的朋友圈,以及生物网络中的功能团。大图上的匹配的定义本身并一定是基于子图同构。因为网络上考虑的更多的是两点之间的连接性关系。根据连接性关系,找到查询图Q的所有匹配位置。因为通常复杂网络中的节点数目是海量的,为了减少搜索空间,将图结构中映射到向量空间。通过在向量空间的操作,找到所有的候选匹配位置;然后在原来的图结构中确定最终的匹配结果集。图数据挖掘可以帮助我们从海量的图数据中找到有用的知识,其中频繁结构模式挖掘和结构相关性挖掘是两个重要的课题。目前的结构模式挖掘算法大部分采用“生成-检测”的算法框架。这种方法的缺点是“检测”阶段耗费大量时间。根据图数据的特例“树数据”的特点,采用模式增长的方式设计频繁结构模式挖掘算法,从而避免了检测阶段。给定一个查询图Q,希望从图数据库中找到与Q具有高度相关性的子结构。这个问题的难点在于海量的搜索空间。为了加快算法响应时间,根据模式增长的策略,设计一种有效的过滤策略。用图结构来表示关系型数据库中的记录之间的“控制”关系,从而将传统的Top-K查询问题转换为图结构中的遍历问题。与现有的经典Top-K查询算法相比,这种方法的优点是其搜索空间较小。
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