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肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)是明串珠菌属(Leuconostoc)中的一个种。目前该种被分为四个亚种:肠膜明串珠菌肠膜亚种(L.mesenteroides subsp.mesenteroides)肠膜明串珠菌右旋葡聚糖亚种(L.mesenteroides subsp.dextranicum)和肠膜明串珠菌乳脂亚种(L.mesenteroides subsp.cremoris)及L.mesenteroides subsp.suionicum。本研究以青藏高原部分地区植物和乳制品中收集到的41株肠膜明串珠菌代表菌株,及4株标准肠膜明串珠菌亚种为研究材料,采用多位点序列分型技术研究这些菌株的多样性和遗传进化关系,从而探究菌株亲缘关系与分离样品种类及分离地区之间的关联性。选取8个单拷贝持家基因pyrG、groeL、rpoB、recA、uvrC、murC、carB、pheS进行核苷酸序列双向扩增,获取目标片段的序列进行核对拼接后绘制出等位基因图谱,从而确定不同的ST序列型(sequence type,ST)。结合持家基因的G+C含量、dn/ds比率,核苷酸多态性等其他相关信息进行分析。45株肠膜明串珠菌共产生25个ST型,多样性高达55.6%。4株标准菌株的序列型各不相同,均对应一个独特的ST型。而41株分离代表株中,来自乳制品的16株菌被分为10个ST型,多样性比达到62.5%。而分离自植物的25株菌株则形成11个不同的ST型,多样性比只有44%。在这25个不同的ST型中ST8、ST17、ST19包含的菌株最多,各自均含有4株菌,分别占全部菌株的8.9%;而ST9、ST10、ST13与ST14则都包含3株菌,各占6.7%;ST7、ST11和ST12各有2株菌比例分别为4.4%。其余的ST型则为独特性即一个ST型对应一株菌株。25个ST型经过eBURST分析构成4个分型组、15个独特型。四个分型组中一个为CC克隆复合体,三个为双联复合体。其中克隆复合体CC9包含4个ST序列型,含有10株分离株,占整个菌株的22.2%,以ST9为中心,因此ST9应是较为原始的序列型。双联复合体分别是ST18和ST19、ST8和ST25、ST6与ST13。通过最小生成树和聚类分析,本研究中来自青藏高原部分地区的肠膜明串珠菌,菌株之间的亲缘关系并没有表现一个地区的菌株呈现单独的聚集,说明分离地区与菌株之间的关联性相对较弱。而亲缘关系与分离样品种类则存在较为明显的联系,大多数菌株与样品种类呈现正相关性,即同一类样品分离的代表菌株亲缘关系较近。