中国人群中肺癌与CAK基因多态的相关性研究以及ERCC1基因多态与肿瘤相关性研究的Meta-分析

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许多环境风险因素例如辐射、气体污染、重金属(砷、铬,镍),多环的芳香烃化合物等都对肺癌发生有作用,约90%的肺癌与烟草暴露有关。尽管如此,吸烟者中却只有少于20%的人发展成为肺癌。另外,还有许多肺癌患者从不吸烟。这些事实说明,除了尚有其它环境因素的参与外,遗传因素在肺癌发生中可能起到相当重要的作用。CAK组分:Cdk7、MAT1和cyclin H,充当在细胞周期控制、转录控制,和DNA损伤修复过程中起重要作用,而这些过程都是与肿瘤发生相关。在这篇论文中,我们在中国人群中检验了我们的假设:CAK基因多态会影响肺癌风险。我们从医院获得临床样本,选择了CAK三个基因共25个SNP位点,并据此构建了Cdk7,MAT1和cyclin H的连锁不平衡block,我们比较了SNP和单倍型在疾病对照组中的分布。结果显示,rs2020892(p=0.042)和rs973063(p=0.005)两个位点的基因型分布在疾病和对照中存在显著差异。进一步分析显示rs3093816,rs2284704,rs4151208,rs2020892和rs973063五个位点在显性遗传模型中明显影响肺癌易感性,而rs3093819和rs4151183两个位点则在隐性遗传模型中改变肺癌风险。我们在非吸烟人群中发现了cyclin H等位基因与肺癌之间的强烈关系,单倍型‘TAC’(p=0.007)显著提高肺癌风险而单倍型‘TTC’(p=0.043)显著减少。我们通过MDR(多因素降维)分析软件来检验CAK的基因基因之间的相互作用以及基因环境相互作用。我们发现CAK三个基因之间存在着明显的相互作用,而基因与吸烟等环境因素之间没有明显的相互作用,基因与环境因素结合后并不增加风险判断的准确性。这一部分归纳如下:通过病例—对照分析发现,CAK基因Cdk7,cyclin H和MAT1的多态性可能以微效基因的方式影响肺癌发生风险。而我们进一步通过LD(连锁不平衡)block单倍型的分析发现,三个基因多态之间存在互作,与它们蛋白水平上的互作现象一致。但是基因多态与环境因素之间的作用却没有发现。我们在第二部分工作中,对ERCC1基因多态性与肿瘤的关系进行了Meta—分析。核苷酸切除修复与肿瘤发生密切相关,而ERCC1核苷酸切除修复系统重要的作用分子,与ERCC11、XPF和ERCC4形成复合物而发挥功能,这种复合物是重组修复和核苷酸外切修复所必须。ERCC1基因与肿瘤相关性研究最多的是T19007C和C8092A两个位点,但各个研究的结果却不一致。我们对这些研究进行了Meta—分析以期验证它们是否与肿瘤相关。在总体人群中,19007C等位基因(病例组中3,853和对照组中4,349)相对19007T等位基因在肿瘤组和对照组中没有显著性差异(P=0.39,odds ratio(OR)=0.95;95%confidence interval(Cl)0.85-1.06,Pheterogeneity=0.001)。我们接下来按照种族进行分层,无论是亚洲人群还是高加索人群,该位点位点都没有分布上的显著差异。而且在所有研究肺癌的研究中,19007C等位基因(病例组中2,279和对照组中2,808)对19007T等位基因也没有显著性差异(P=0.72,OR=0.94,95%Cl 0.69-1.29,Pheterogeneity=0.0001)。C8092A位点情况也类似,A等位基因(病例组中3,865和对照组中3,750)并没有影响肿瘤风险(P=0.85,OR=1.01 95%Cl 0.94-1.08,Pheterogeneity=0.92)。同样的在不同种族中也不存在作用。在鳞状上皮细胞肿瘤中,A等位基因(病例组中501和对照组中620)也没有显著作用。综合这些分析结果,我们认为ERCC1基因T19007C和C8092A两个位点与肿瘤具有相关性的证据不足。在T19007C的所有研究报道中存在异质性,而异质性的来源主要是Zienolddiny等人的报道,这篇报道选取的都是吸烟人群,与其它报道不同,而且在该报道中19007C等位基因是肿瘤保护因素。总体而言,由于目前的研究还比较少,还存在一定异质性,尤其是对吸烟人群的研究不够,所以为了阐明这两个位点与肿瘤的关系,还需要更多的研究。
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