工业园区是加快区域经济发展的必经之路,主导产业是引导一个工业园区产业结合优化和稳定繁荣的产业。在我国经济飞速发展的过程中,对工业园区的发展相对粗犷,招商引资企业有些并未完全规范,因此对工业园区提出选择主导产业方案原则,并对其供应链结构进行优化设计,能快速带动区域相关产业发展,减少恶性竞争和资源浪费也发挥重要作用。以昆明工业园区作为研究对象,运用层析分析法等选择出主导产业或有发展潜力的产业,在对其供应链现状、存在问题等进行分析的基础上,引入第三方物流企业整合现有供应链。主要体现三个方面：以市场需求制定生产计划、建立实时完整的信息系统和重新设计供应链中采购、销售相关物流网络。建立供应链企业利润分配模型,以宜良工业园区饲料供应链为例进行整合和利润分配实证分析,最后提出发展建议。研究结论为：(1)工业园区选择主导产业的必要性,由主导产业规范整合的供应链有较强的稳定性和效率性,并能在供应链提供信息系统等新技术,加速发展；(2)引入第三方物流企业以客户为主,信息技术为核心,供应链网络设计为依托,成本控制为目的来优化供应链；(3)维持供应链的稳定和高效,企业需合理的利润分配原则。可以以效率公平原则、风险收益原则、利益均等原则或者整体协同原则进行利润分配,以供应链实际情况为准,本文选用效益公平原则进行实证分析；(4)以宜良工业园区主导产业供应链进行实证,提出外包非核心业务形成供应链一体化发展、建立信息化和标准化等建议,对工业园区主导产业的供应链设计优化有一定借鉴作用。