本研究以我国北方天然草原主要的烈性毒草和水土保持植物醉马草(Achnatherum inebrians)为研究对象,对醉马草微卫星引物开发、遗传多样性、内生真菌对醉马草抗寒性的影响等方面进行了研究。主要结果如下:1.通过不同低温胁迫条件下醉马草种子的萌发试验,明确了内生真菌可以提高醉马草种子的发芽率、发芽速度、促进胚根、胚芽的生长,在10℃低温胁迫条件下,醉马草E+植株的发芽率、发芽指数、胚芽和胚根长显著高于E-植株(p＜0.05)。2.通过对醉马草幼苗的长期低温生长试验,明确了内生真菌能够明显的促进E+植株的地下生物量的积累(p＜0.05),增加或者维持醉马草的地上生物量,引起生物量格局的重新分配—使植株根冠比增大,使植株抗寒能力增强。3.通过对醉马草幼苗在短期低温胁迫下的生理生化特性研究表明:低温胁迫下醉马草的渗透调节系统,膜系统及光合系统均受到不同程度的损害,在5℃条件下,抗寒能力较强的醉马草带菌(E+)植株在可溶性蛋白含量、可溶性糖含量、SOD、CAT等酶活性、Fv/Fm值方面均高于不带菌(E-)植株(p＜0.05)。4.通过对醉马草成株的田间自然越冬试验,明确了内生真菌能够明显促进E+植株的越冬存活率和返青再生能力。5.通过磁珠富集文库法成功开发了12对醉马草SSR引物,且证明其中90%的引物可以成功应用于芨芨草属其它禾草的遗传多样性研究。6.通过应用6个微卫星座位,对8个醉马草自然居群共计80个个体的遗传多样性进行了分析表明,醉马草遗传分化程度较高,遗传多样性丰富。基于SSR标记的UPGMA聚类分析与主成分分析表明,8个醉马草自然居群能按照采集地点的不同分为新疆和甘宁青两组,地理距离与醉马草的遗传距离呈显著正相关(p＜0.05)。