宁波地区H7N9流感病毒分子流行病学特征分析

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目的:掌握宁波地区人感染 H7N9禽流感的流行特征和临床特点。全面了解宁波地区 H7N9流感病毒的基因变异情况,从分子生物学水平上掌握其变异特点和规律,为进一步认识与防控 H7N9禽流感提供科学依据。  方法:  1、本研究依托宁波市疾病预防控制中心,收集2014年宁波市人感染 H7N9禽流感确诊病例资料,采用描述性流行病学方法,分析其流行特征及临床特点。  2、选取2014年 H7N9禽流感阳性样本进行核酸提取,通过 PCR扩增和测序方法获得11株 H7N9禽流感病毒全基因序列,最后运用 MEGA5.2、DNASTAR与 Datamonkey等相关生物信息软件进行基因片段的拼接、比对和分析。  结果:  1、2014年宁波市共确诊人感染 H7N9禽流感病例15例,死亡4例,病例平均年龄为54.33±3.99岁;所有病例发病前均有禽类暴露史;15例病例的103名密切接触者均未感染;病例初期临床表现大多为流感样症状,如发热、咳嗽、头晕等,随着病情的进展可出现呼吸衰竭、重症肺炎等疾病,大部分病例有慢性基础性疾病。  2、11株 H7N9流感病毒的8个基因片段核苷酸同源性分析结果表明,8个基因片段核苷酸同源性在95.5%~100%之间;H A基因与 A/duck/Zhejiang/12/2011(H7N3)禽流感病毒株同源性为99.4%~99.7%,NA基因与 A/wild bird/Korea/A14/2011(H7N9)的同源性为95.8%~96.1%;6个内部基因中,N S基因与 A/chicken/Dawang/1/2011(H9N2)同源性为98.3%~98.8%,而其余5个基因与A/brambling/Beijing/16/2012(H9N2)高度同源。  3、系统进化树结果表明,2013~2014年 HA,NA基因进化树形成了两个分枝(W1,W2),W2分成3个不同分枝(W2-A,W2-B,W2-C),11株宁波毒株同在 W2-A分枝上,与绍兴、湖州等地的参考株属同一分枝;所有内部基因均来自于 H9N2流感病毒分枝,共分出3个明显的进化枝(clade1,clade2,clade3),11株毒株的全部内部基因与第二起疫情的华东地区参考株同属 clade1分枝。  4、选择压力分析表明,8个基因片段共有11个基因位点属于阳性选择位点,其中 HA基因的4个(183,195,235,324)、NA基因的1个(384)、PB2基因2个(390,627)、PA基因1个(627)以及 NP基因2个(100,276)。所有基因均存在负选择位点。  结论:  1、老年男性,特别是有慢性基础性疾病者是宁波市人感染 H7N9禽流感病例的易感人群;病例发病可能与禽类暴露有关,暂未发现人传人的证据;暂停活禽交易,关闭活禽市场是控制疫情扩散的有效手段。  2、人感染 H7N9禽流感以急性呼吸系统损害为主要临床表现;病例病情进展迅速,病情较重;早期发现和救治患者是提高患者预后的关键。  3、宁波市人感染 H7N9流感病毒与浙江省其他地区流行株高度同源。  4、宁波株基因编码区受到了正向进化压力的作用,可能是新型 H7N9流感病毒产生变异的原因。
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