随着科学技术的迅猛发展,大学学科的发展改变了传统的知识专门化趋势,学科交叉融合在当代已显得越来越重要,它是解决重大技术、社会问题的必然选择之一。独立科研机构的建立是高校促进交叉学科发展的有效措施,也是“矩阵式”交叉学科机制的重要载体,它的建设是高校提高创新能力的重要途径。本文的研究视角指向交叉学科研究成果迭出的美国,通过定量和定性相结合的方法,对美国部分研究型大学独立科研机构的发展规模和具体机构的个案展开分析,在此基础上对比分析我国研究型大学建设过程中的若干方面,以期为我国研究型大学独立科研机构的建设提出可供借鉴的启示。研究首先通过对美国部分研究型大学独立科研机构发展的数量、与高校内其它科研机构的数量对比发现独立科研机构在高校科研机构发展力度,即在跨学科科研机构中,约有三分之一的机构建设成为独立科研机构。通过对其中五个独立科研机构案例的进一步总结发现:美国部分研究型大学独立科研机构实行主任负责制、人才队伍来源广泛、资金来源各有特色、政府和学校的政策扶持、研究内容具有前瞻性、设施先进、合作广泛。对比之下,国内部分研究型大学虽然已经在独立科研机构上开始了探索,但是发展规模较小、难以吸引优秀人才、资金来源单一、科研人员生存压力过大、多学科合作存在困难。文章最后结合我国国情和高校特点,对促进我国研究型大学独立科研机构建设提出如下建议:创新组织结构、获得方针政策的支持、吸引优秀人才队伍、设立多样化基金项目、定位研究内容的前瞻性、扩大合作领域、整合设施平台。