随着我国城市化进程的不断发展，大量农村剩余劳动力转向城市就业，而农业收入在农民收入结构中的比例呈现逐渐下降的趋势，这就使得部分农民不愿继续从事农业劳动，转而从事其他非农行业。但是，由于农民对土地的情感难以割舍，导致农民又不愿意完全脱离土地，只好将自己承包土地的经营权租赁或转让出去，以获得一定数量的经济收入，也防止土地撂荒。　　在研究中发现，由于农民自发进行的农村土地承包经营权流转，会有很多弊端，导致既不能满足城市化进城的顺利开展和农业生产的机械化以及规模化经营，也不能有效保障农民的利益。由于农民缺乏相关法律和有关政策常识，当农民的利益受到侵害时，他们往往无路可寻，只好采用上访或者更为极端的方法来表达自身利益诉求。这样就会给农村稳定发展和基层政府带来很大压力，所以，加强农村土地承包经营权流转对农民利益的影响和对策研究十分必要。　　本文通过分析国内外研究的经验及目前还存在的问题，结合相关理论基础，对重庆市奉节县进行实地调研，通过调研获得一手资料，总结奉节县取得的经验以及存在的一些问题。通过构筑计量模型分析得出，农村土地承包经营权流转对大部分农民的收入起到促进作用；通过对奉节县所取得的成绩来看，在进行土地流转过程中对农民的部分权益也起到了一定的保障作用。但是，并不是所有的农民都能经过土地流转实现华丽的转身，这就说明当前农村土地承包经营权流转对农民利益的维护方面还存在有待改进的地方。　　由于农民利益牵扯到各个方面，所以在不同的发展阶段和不同地区会出现各种各样的情况，因此我们就要做到具体问题具体分析，要把握主要矛盾和矛盾的主要方面。通过分析土地承包经营权流转和农民利益之间在发展过程中存在的一系列辩证关系和不同发展阶段的矛盾及原因，提出建议：第一，通过完善法律法规加强对农村土地流转的规范，加大对流转各方的利益协调力度；第二，提高农村剩余劳动力的再就业率；第三，完善农村各项社会保障机制，将会有利于农村土地承包经营权流转和农民利益的维护。　　农村土地承包经营权流转和农民之间的利益密切相关，其复杂性的辩证关系受其发展的历史阶段所影响。所以，解决农村土地承包经营权流转与农民利益之间的矛盾，既不能急于求成，也不能顽固不化，既不能照搬照抄他国经验，也不能“闭门造车”。而是要善于借鉴其他地区和国家的成功经验，同当地发展实际相结合，根据我国实际情况逐步制定出适合本地农村土地流转发展的具体措施。