如今,技术创新成为区域经济发展和竞争力提升的决定性因素,区域技术创新能力的提高离不开完善的创新环境,良好合理的区域创新环境体系是提高创新绩效的基本保障。由于我国各省市间发展不平衡的问题突出,且不同地区具有差异化的优劣势和资源禀赋,导致创新环境对创新绩效影响的效率不同,区域差异显著。本文将经济水平、基础设施、人力资本、市场需求、科学技术、政府支持,纳入到创新环境对创新绩效影响的效率测度指标体系,应用SBM模型对我国30个省市创新环境对绩效影响的技术研发和成果转化两个阶段的创新效率进行评价,并利用K-Means聚类分析法,将30个省市划分为高研发高转化、低研发高转化、高研发低转化和低研发低转化四类区域,同时结合东部地区、中部地区、西部地区和东北三省四大板块的区域划分方式进行区域差异的深层剖析。然后,构建基于区域差异的创新环境对创新绩效影响的系统动力学模型,选取区域差异性显著的不同类型的城市:北京、天津、黑龙江和山西四个省份作为研究对象,进行相应的模拟仿真分析。最后,结合区域差异及趋势发展规律,给出提升创新环境创新绩效的建议。结果表明,我国区域差异显著,东部和东北三省的创新环境对创新绩效影响的研发效率高于中西部地区;中东部地区的创新环境对创新绩效影响的转化效率高于西部和东北三省。东部大部分省份位于高研发高转化区域;中部大部分省份位于低研发高转化区域;西部大部分省份属于低研发高转化和低研发低转化区域;东北三省则均为高研发低转化地区。而且,大部分省份的科技成果产出在2011-2030年间是持续增长的,且不同的区域创新环境要素在创新环境对创新绩效影响的效率方面,具有不同的作用。通过从投入产出及区域差异、均衡的角度展开对区域创新环境各要素对创新绩效影响的效率关系的分析,本文为区域创新环境的研究提供了新视角,建立的区域创新环境参与下的创新绩效差异区域的变化趋势仿真模型,一定程度上为政府调控提供理论指导。