基于microRNA深度测序的猕猴桃性别分化初探

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猕猴桃是一种富含维C的重要经济果树,同时也是一种功能性雌雄异株植物,其花在发育过程中发生雌蕊或雄蕊的败育,逐渐由两性花发育成为单性花。猕猴桃的性别由一对形态相似的XY性染色体决定,其性别决定区域位于染色体的亚端粒部位,然而对其性别分化机理的研究尚未清楚阐明。植物中的microRNA(miRNA)是一类长约21nt的小分子非编码RNA,通过与靶mRNA中的互补位点配对形成RNA诱导的沉默复合体,剪切mRNA使其降解或抑制其翻译,以转录后调控的方式参与多种植物生长发育过程。本研究利用新一代高通量测序技术,对猕猴桃雌雄花中表达的小RNA进行了测序,分别得到雌雄花18408610和11191469条读序列。通过生物信息学分析,共鉴定和预测得到39个保守miRNA家族和400个新的miRNA家族,其中有170个miRNA家族在雌雄花样品间显著差异表达。对差异表达miRNA进行靶基因的预测及注释,结果显示,靶基因产物具有包含核苷三磷酸水解酶的磷酸环结构域的miRNA数目最多。在猕猴桃25号连锁群(Chr25)上共预测得到3个miRNA,其中novel-ach-miR362的靶基因Achn298021可能与猕猴桃花的发育有关。
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