近年来,我国经济发展进入新常态,要素驱动这种传统的经济增长模式遇到了阻碍,转变经济发展模式,实现经济的高质量中高速发展,是当前亟待解决的问题。创新,作为驱动发展的首要动力,能给经济体系现代化建设起到支撑;城市作为现代化建设重要载体,在创新驱动中扮演无法替代的角色,因此城市创新水平将直接影响国家经济发展的可持续性。城市创新水平的提升依托于政府支持,政府在财政政策、资源配置等方面的导向,将直接影响城市整体发展的方向。政府层级改革是我国全面深化改革、加速转变政府职能的重要组成部分,会对企业和科研机构的研发创新活动带来影响,进而影响城市的整体创新水平。从我国城市发展的历程来看,政府层级改革和行政区划调整是我国政府提高空间和资源的配置效率,优化区域和城市结构的有效途径。改革开放以来,政府层级改革在城市层面主要通过两种方式实现,一是撤县设区,扩大现有城市规模;二是撤县设市,增加城市的总体数量。“撤县设区”政策在增强中心城市实力、带来更广阔发展空间的同时,也给辖区内政府的政策制定和实施带来了一定影响,这种政府层级改革是否对城市创新水平有促进作用,则有待检验。本文首先基于行政区划理论和创新理论,分析了我国政府层级改革可能影响城市创新的机制。撤县设区本质上是扩大了城市规模,可能会带来市场扩大效应和要素扩张效应,进而拉动城市整体经济发展和创新活动的加速开展,同时撤县设区减少了地方政府层级数量,有利于政府职能优化,行政效率也会提高,此外,撤县设区还会加速城市基础设施和相关公共服务建设,给城市创新发展创造有利条件。本文进一步利用2010-2017年国家实施的撤县设区改革自然准实验,基于同时期城市面板数据,利用多期双重差分法,检验了政府层级改革对城市创新水平的影响,结果发现,撤县设区会显著促进城市创新水平的提高,并且这一结果在我国东部和中西部地区均十分显著。同时,通过机制分析表明政府科教支出的提高和城市基础设施的完善是两个有效的路径。政府在科技和教育两方面支出的提高,能为企业加大研发力度、学校和科研机构开展科技创新带来更多的资金支持,还能为当地培育更高素质的人才创造有利条件,通过提高城市人力资本,为城市创新水平提高提供人才储备。政府主导加大城市道路建设等基础设施的改善,能为城市创新活动开展提供更好的硬件支持,同时也优化城市内部和对外的交通运输、信息传输的便利城市,也有利于城市创新水平的提高。基于上述结论,本文提出如下政策建议:（1）要明确政府在城市创新活动中的角色定位,发挥政府在创新驱动发展战略中的重要作用。（2）要加强政府对城市创新活动的支持和引领,加大政府科技和教育支出,制定推动区域创新发展的地方政策,以及激励企业开展研发创新活动。（3）要规范政府参与城市创新活动的行为,应当加强对政府创新支出行为的监督和提高政府官员的专业素养,保障城市创新活动的开展。