纳勐铜多金属矿区与普卡大型斑岩型-矽卡岩型金铜矿床属同一构造成矿带，地质、构造、岩浆岩、蚀变矿化特征类似，显示了纳勐矿区巨大的找矿前景。　　 研究表明，纳勐铜多金属矿区主要出露的地层为石炭系结晶灰岩、侏罗系粉砂岩以及第四系。矿区褶皱构造主要表现为残缺背斜，轴向近东西向，断裂构造分为近南北向、近东西向以及北东、北西向。矿区岩浆岩活动频繁，主要的侵入体为黑云母二长花岗岩侵入体、钾长花岗岩侵入体、浅色细粒花岗岩侵入体以及斑岩侵入体。其中黑云母二长花岗岩为矿区的成矿母岩。　　 矿区矿体主要产在灰岩与花岗岩的接触带上。矿体产状主要为透镜状、不规则脉状以及似层状。矿石中主要的金属矿物为黄铜矿、辉铜矿、磁铁矿、闪锌矿等。矿石的结构以交代结构、交代充填结构、固溶体分离结构为主，矿石构造主要以浸染状构造、脉状构造和块状构造为主。　　 矿床地质特征显示，纳勐铜多金属矿为典型的矽卡岩型矿床。矿石硫、铅同位素以及稀土元素特征表明，成矿物质主要来源于深部岩浆。接触带上由陡变缓、由缓变陡处、以及岩体的凹部则为富矿体的赋存空间。　　 综合地质、物探资料，在矿区划分出三个成矿预测区，为进一步勘查工作提供了理论依据。