青藏高原冰芯细菌Cryobacterium属基因组特征及其与环境关系

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lsui321
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
青藏高原是除了南北极之外中纬度地区冰雪覆盖面积最广的区域。冰川作为保存生物的良好载体,按照时间顺序保留了大量的微生物,同时冰川也可以良好的反应过去的气候环境,因此通过研究冰川微生物来了解过去气候环境变化是一个非常理想的途径。过去对冰雪微生物的研究主要集中于群落多样性、数量分布特征及其与气候环境之间的关系。对青藏高原冰川微生物的生理特征尤其是基因组特征的研究鲜有报道。因此在本研究中,我们选取青藏高原木孜塔格冰芯、玉珠峰冰芯及扎当雪坑可培养细菌进行温度、盐度及pH生长特征的研究。此外,选取木孜塔格冰芯、玉珠峰冰芯及宁金岗桑冰芯中15株Cryobacterium(冷杆菌)属细菌及分离自韩国土壤该属中温菌C.mesophilum CGMCC1.10440,结合Cryobacterium(冷杆菌)属已发表的的7株细菌基因组进行比较基因组学的分析,以期揭示冰川环境对冰川微生物的影响及冰川微生物对冰川环境的适应机制。  通过对青藏高原木孜塔格冰芯、玉珠峰冰芯及扎当雪坑中81株可培养细菌生理特征的研究,得出青藏高原木孜塔格冰川、玉珠峰冰川及扎当冰川可培养细菌以耐冷菌为主,冰雪微生物比非寒冷环境中同属微生物具有更广的低温适应性。通过对Cryobacterium(冷杆菌)属23株细菌基因组的研究分析,得出以下结论:(1)16S rRNA基因及全基因组系统发育进化树上冰川菌聚在一个大的分枝上,中温菌C.mesophilum CGMCC1.10440处于系统发育树的根部。(2)冰川菌之间的平均核苷酸相似性(ANI)、同源蛋白质相似性高于冰川菌与中温菌之间的值。(3)总结Cryobacterium属(冷杆菌)细菌基因得失过程,推测环境差异导致冰川细菌和中温菌经历了不同的基因组变化过程。冰川菌经历了多个阶段的基因得失过程,先以获得基因为主后以丢失基因为主。从冰芯分离的冷杆菌基因组中含有更多的次级代谢及抗胁迫的基因,使用更多的疏水氨基酸,可能是其适应冰川环境的重要因素。
其他文献
青藏高原是世界的“第三极”,平均海拔在4000m以上,巨大的山体阻隔了南来的印度洋暖湿气流,使得高原内部广大地区形成了特有的干旱半干旱植被景观。总体呈东西走向的雅鲁藏布江,
文章概况地介绍了澳大利亚煤炭工业所发生的一系列变化,并列举了目前煤炭产量的统计数据。文还介绍了一些新建洗煤厂以及所采用的洗选工艺,总结了有关重介加工、粉煤处理、浮
江泽民同志关于“三个代表”的重要思想 ,集中体现了党的根本性质和宗旨 ,体现了在建设有中国特色社会主义伟大事业进程中政治、经济、文化全面发展的要求。其中 ,关于我们党
河南省襄城县教体局教研室教研员  “教什么永远比怎么教重要”,王荣生教授说的是教学内容选择的重要性。阅读教学教什么最有效,文本的什么内容最具有教学价值,最能体现语文学科的核心价值,最能培养学生的学科语文素养。笔者认为阅读教学应该关注文本的四个层面:即文本写了什么,是怎么写的,为什么这样写,为什么写。  一、第一个层面:文本写了什么  学习一篇课文首先要读懂文本写了什么,就是要搞清楚文本主要讲的是什
期刊
本文通过对荣华二采区10
期刊
提高工作水平 ,是创造性开展工作的必然要求。当前改革与发展正处于关键时期 ,我们不仅面临着艰巨的经济建设任务 ,而且要应对一系列新情况和新问题 ,还要解决改革和发展过程
邓小平同志关于大胆选拔和起用中青年干部的论述,是邓小平理论的重要组成部分。在《邓小平文选》第三卷中处处闪烁着他在这一方面的深思熟虑和高瞻远瞩。紧密结合当前机构改
城乡结合部是在城市和乡村体系基础上衍生出的过渡性地域单元,是城市快速扩展的重点地区,同时也是我国土地利用问题最多、矛盾最尖锐的地区。因此,在当前我国城市快速扩张的
汞是一种毒性很强的重金属元素,因其具有较长的停留时间和较广的传播范围,受到世界上众多国家和组织的关注。随着全球变化的加剧,高寒环境下冰川与河流汞的地球化学循环受到越来
介休市大靳乡东欢村共产党员蔺成龙 ,是个有27年党龄的老党员 ,由于放松了自身的学习和改造 ,于1994年加入了基督教会 ,并经常参加教会活动。大靳乡党委于1995年、1998年分别给予他警告和留