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目的：肺癌是全球范围内发病率最高的恶性肿瘤之一，而且有逐年增加的趋势，严重威胁着人类的健康。目前，临床工作中仍然缺乏能够评估肺癌患者预后并指导综合治疗的肺癌标记物。在这一指导思想下，我们对S100A4基因在肺癌组织中的差异表达以及与肺癌组织分化和转移的相关性进行研究，以指导肺癌的治疗和评估预后。方法：通过提取46例肺癌患者的肺癌和配对的正常肺组织以及4个肺癌细胞系(腺癌细胞系A549、GLC-82、小细胞肺癌细胞系NCI-H446、大细胞肺癌细胞系HCI-H460)的总RNA，用半定量的逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测S100A4基因在肺癌和配对组织以及肺癌细胞系mRNA水平的差异表达情况，用Multi-Analytist显像系统进行定量测定并分析PCR结果。并结合肺癌患者的年龄、性别、肺癌的病理类型、组织分化程度、淋巴结转移情况等临床资料进行分析。结果：在46对肺癌及配对组织中，有29例(63.0％)肺癌组织中的S100A4基因的表达明显增强。其中低年龄(＜50岁)肺癌患者组、低分化肺癌组、发生纵隔淋巴结转移的患者、Ⅲa期肺癌患者S100A4基因的差异表达更为明显，分别为89.5％ vs 44.4％、81.0％ vs 48.0％、77.3％ vs 20％、73.1％ vs 0，(p＜0.05)，而S100A4在不同病理类型之间、肺癌瘤体大小之间的表达率差异不明显；S100A4基因在4个肺癌细胞系中均呈现阳性表达。结论：S100A4基因在肺癌组织的表达明显高于正常对照组织，而且其差异表达率与肺癌组织的分化程度、肺癌患者是否发生纵隔淋巴结转移以及临床分期密切相关。S100A4基因的发现不仅为肺癌的病因学病理学研究提供了一个新的线索，值得进一步的深入研究，并且有希望为评估肺癌患者预后提供一个可靠的标记物，并成为治疗肺癌的一个新的靶点。