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月季是世界公认的四大切花之一，其以花姿优美、花型丰富、花色齐备、花香多型等深受人们喜爱，赢得了“花中皇后”的美誉，被许多国家、城市选为国花、市花。
本研究首先以优良月季品种“萨蔓莎”为试材，以带腋芽的茎段为外植体，比较了含2％有效氯的次氯酸钠不同浸泡时间对外植体的消毒效果，研究了不同激素浓度配比和活性炭的添加对腋芽萌发、增殖及芽苗生根的影响。实验结果表明，用有效氯为2％的次氯酸钠浸泡外植体的最适消毒时间：在春季是8 min，而在秋季为12 min；腋芽萌发的最适培养基是MS+6+6BA1.0 mg／L+NAA 0.1mg／L；腋芽增殖的最适培养基是MS+6-6-BA1.5 mg／L+NAA 0.1 mg／L；芽苗生根的最适培养基为1／2MS+0.7 mg／LNAA+0.3％活性炭。以上述系列培养基为基础，建立了“萨蔓莎”的离体培养再生体系，为运用基因工程技术进一步改良该品种奠定了重要基础。
然后，本研究以“萨蔓莎”叶片为试材，对ISSR反应体系中的各主要影响因子进行了优化，建立了月季ISSR-PCR的最适体系：在25μL的PCR体系中，含10×Bufier(无Mg<2+>)2.5μL、1.5 mM Mg<2+>、0.48mM dNTPs、Taql)NA聚合酶1μ、引物0.6 mM和模板20ng。反应程序为：94℃5min；94℃45s，54℃60s，72℃90s，35个循环；72℃6min；4℃保存备用。再以此ISSR-PCR最适体系为基础，从77个ISSR引物中筛选出12个多态性丰富的引物进行PCR扩增，共获得104个DNA片段，分子量在100～2000 bp之间，其中多态性条带96个，占总条带的92.3％。选用其中8个引物进行ISSR-PCR，即可准确区分所有供试的20个月季品种，成功构建了其ISSR分子标记指纹图谱；同时利用PHYLIP法获得了聚类分析图，聚类分析结果表明，供试的20个月季品种可分为5大类。上述ISSR-PCR的研究结果为月季种质鉴定、遗传多样性分析等提供了重要依据。