多抗用于快速比较未纯化酶/突变体的比活性

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xxzzxx_100
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
酶的分子工程是生物技术领域研究的焦点,目前主要包括合理设计和定向进化。突变体的合理设计需要建立在了解酶的活性-构效关系的基础上,不仅在技术上具有挑战性,而且需要巨大的计算量;因此,通过建立起始酶突变体文库的定向进化更常用。理论上来讲,纯化后突变体比活性的比较可以用于识别阳性突变体,但是突变体数量巨大,纯化过程的成本和时间消耗极大地阻碍了筛选效率。在诱导表达后,希望借助细胞裂解液中酶与突变体比活性的比较识别阳性突变体,但不同单克隆诱导表达丰度差异巨大。显然,酶的定向进化需要能可靠识别阳性突变体的新策略。  在前期实验基础上,利用固定在微板孔的抗6His单抗与羧酸酯酶(Est1)及其突变体M326L,以及使用Ni2+-NTA磁性颗粒与大肠杆菌碱性磷酸酶(ECAP)及其突变体R168K,已经被证明可有效预测Vs以识别阳性突变体,该方法已获得专利。不幸的是,微孔板固定单抗其应用范围窄,亲和力不够,抗His标签的单抗适合于预测6His标记Est1/突变体的Vs,而对6His标记的ECAP和6His标记的铜绿假单胞菌芳香族硫酸酯酶(PAAS)都是无效的;此外,Ni2+-NTA磁性颗粒会抑制PAAS/突变体酶的活性,且抑制作用对不同突变体不一致,其对细胞裂解液中酶丰度的要求也较高。因此,在前期已有方法学的基础上,考虑将多抗作亲和吸附剂,其结合反应的亲和力、适用范围、成本、耗时等方面均有所改进。  1.微孔板固定硫酸铵沉淀粗制多抗比较未纯化酶/突变体的Vs  重组表达并亲和纯化6His-ECAP及6His-PAAS使其纯度达85%以上,生理盐水稀释纯样品并与弗氏免疫佐剂乳化作为免疫原,注射5次取全血分离血清得相应抗血清,将抗ECAP兔抗血清用33%的硫酸铵沉淀得粗制多抗,再用pH6.0的MES缓冲液在DEAE-纤维素柱中纯化得到纯化多抗。在前期研究基础上,将粗制多抗固定在96孔ELISA板中,ECAP及突变体R168K诱导表达后的细胞裂解液作为样品,测得活性及蛋白浓度后,再应用响应曲线拟合的方法对吸附的酶/突变体进行定量活性比较。4.0ml培养体积诱导表达后的样品裂解液中,ECAP的活性达19.7±5.7 KU/g(n=12),而 R168K的活性为36.7±15.1 KU/g(n=12)。其活性比率比亲和纯化两次后用传统方法测得比率大得多(P<0.01)。使用相同批次的ECAP粗制多抗,通过Matalab拟合ECAP与R168K响应曲线估计Vs的比率为1.6±0.1(n=2),通过回归分析得到的比率为1.5±0.1(n=2)。通过两种数据处理方法,ECAP与突变体R168K关于Vs比率彼此一致,并与亲和纯化后用传统方法测定或使用Ni2+-NTA的预测Vs的比率一致,支持了多抗作为亲和吸附剂预测Vs可靠性。  2.磁珠固定纯化多抗预测比较未纯化酶/突变体的Vs  抗ECAP或PAAS抗血清通过33%硫酸铵沉淀和DEAE-纤维素柱得到纯化多抗;磁珠羧基活化后固定纯化多抗备用;  在固定有多抗的磁珠中加入对应酶进行免疫反应,洗去未结合酶,加入对硝基苯酚衍生物类底物显色,强碱终止反应后读取405 nm处吸收增量表示吸附酶活性,对反应体系中加入的总蛋白量可绘制响应曲线,据吸附反应的数学模型拟合响应曲线预测Vs。假定吸附酶与游离酶比活性相同,每克多抗磁珠吸附酶容量约2.0 mg。R168K较ECAP的比活性提高约50%,2.5μg多抗磁珠反应10 min用于预测Vs;PAAS与活性仅低于其25%的突变体G138S,需要10μg多抗磁珠反应20 min预测Vs,而ECAP的酶活力是PAAS的70倍。因此,只要被吸附酶活性能在仪器的检测限内可靠测定,用磁珠能识别活性提高20%以上的弱阳性突变体,故磁珠固定多抗的方法适于预测Vs以识别弱阳性突变体。  3.免疫比浊法预测未纯化酶/突变体比活性  使用PAAS和芽孢杆菌致病尿酸酶(BFU)及其突变体作为模型,测试了基于蛋白层面的免疫比浊(ITA)测定细胞裂解液中酶及突变体的量以获得其比活性。以0.18mL含有0.75mg抗血清的反应缓冲液与0.02mL梯度稀释样品液为固定反应体系,使用酶标仪测定340nm与700nm处的吸光度值。根据ITA的校准曲线在0.4至3.0μg范围内对PAAS或BFU进行定量。在相同诱导表达条件下,批间重复时细胞裂解液中PAAS/突变体的表达丰度基本一致,保证了细胞裂解液中酶/突变体对相同抗血清存在一致的免疫反应性;BFU/突变体的表达丰度与PAAS呈现相同趋势。细胞裂解液中PAAS/突变体或BFU/突变体通过ITA后得到免疫比活性的比值与纯化后常规测定方法测出的比活性比值高度一致。为了识别活性仅高PAAS比活性50%的突变体,48孔微量培养板诱导表达相应酶及其突变体,通过ITA测定并进行ROC曲线分析发现,ITA给出的曲线下面积比活性浓度及表观比活性的ROC曲线下面积高得多。因此,通过ITA对细胞裂解液中酶/突变体的测定有希望获取酶及其突变体的特异比活性以用于阐明序列-活性关系和识别阳性突变体。
其他文献
[目的]基因复制及随后的功能分化是基因组和物种演化的重要驱动力.植物特有的转录因子家族SPL(SQUAMOSA-promoter binding protein like)广泛参与调控植物生长发育及响应逆境
摘 要:我国正由高速发展阶段转向高质量发展,向全面小康的步伐迈进,要建立进一步的社会主义现代化强国,这也就意味着对我国各区域经济发展提出了更高的要求。当前,我国经济发展进入新常态,共建共享共赢的理念受到了人们的广泛关注,这也意味着解决中国区域经济发展问题,提高经济发展总体质量成为了大众所关注的热点。本文对中国区域经济发展差异的原因进行了分析并提出了相应对策,希望以此更好地缩小中国区域经济发展差异,
摘 要: 培养德智体美劳的综合性人才是教学宗旨和教育目标,体育是综合素质中不可或缺的主要因素。文章论述了小学体育趣味教学的意义,阐述了趣味教学应坚持的原则,最后以50米跑为例,具体论述了小学体育教学中趣味教学的具体策略。  关键词: 小学体育 游戏 趣味  体育是综合素质中不可或缺的主要因素,没有健康的体质、强硬的身体素质做基础和后盾,德、智、美、劳等的发展会成为空中楼阁。然而,应试教育的沿袭,体
摘 要: 在小学体育课堂中,一些学生会存在不同程度的自卑心理,这严重影响学生的体育学习,不利于学生身心健康发展。具有自卑心理的学生往往看不起自己,时常对自己进行消极的自我评价,怀疑自己的能力和自己的品行,久而久之,会产生自闭、自暴自弃的严重后果。因此,在小学体育教学中帮助学生克服自卑心理尤为重要。本文阐述了小学体育课中学生自卑心理的表现,并对如何克服学生的自卑心理提出意见和建议。  关键词: 小学
摘 要: 自20世纪90年代以来,C语言迅速在全世界普及推广,C语言程序设计在计算机教育和计算机应用中发挥重要的作用。本文从学生在学习C程序设计过程中遇到的困惑出发,立足在课堂教学中如何引导学生树立良好的学习信心、更好地激发学生的学习热情,展开关于C语言学习方法及兴趣培养等几方面的讨论,希望对学生有所帮助。  关键词: 中职院校 C程序设计 兴趣培养  C语言是国际上广泛流行的一门高级程序设计语言
菲律宾的水果在邻国越南赢得了新的市场。越南农业部在一份声明中称,河内已经确定菲律宾城市马尼拉可向其出口植物性产品。菲律宾驻泰国大使馆农业代表Anna Abejuela称,这是
自从上世纪八十年代末期加入信息技术教育工作行列,至今二十多年,从Basic语言-WPS-Office家族-多媒体信息加工—网络技术应用等,进入现在的网络时代,越教越不知该怎么教,信息技术已经深入生活的每一个领域,但学生一提信息技术就想到上网,教师一提到信息技术就感觉无从下手,技术很多、软件更多,所有的一切都教给学生不现实也不可能,学生的信息素养层次不同,造成教学中无法完全参照教材,教学电脑设备也是
摘 要:随着我国社会经济发展,在新经济环境下,农业想要更好的发展便必须做好农业经济管理工作。进行农业经济管理的时候,必须重视农民经济管理思想以及手段方面的转念,只有这样才能够切实提高农业经济管理的实际质量。笔者主要分析了新时期农业经济管理的实际情况,并进行了优化策略的提出,希望能够给农业经济更好的发展奠定良好的基础。  关键词:新时期;农业经济管理;优化  对于我国而言,农业的重要性不言而喻,只有
棉籽经压榨榨油处理后称为棉籽饼粕,棉籽饼粕是一种优质的植物性蛋白饲料,可以作为理想的蛋白质饲料。在粗饲料不足的中国,可在一定程度上弥补蛋白饲料资源不足。但是,由于棉
摘 要: 近几年以来,随着信息技术的进步和网络教育的不断发展,翻转课堂作为一种新的教育教学模式,在全世界范围内越来越受到广泛的关注。经过几年的探究,翻转课堂已经发展出三种不同的教育模式:一是基于教师个人“微视频”的翻转课堂模式;二是基于电子书包的翻转课堂模式;三是基于“MOOCs”的翻转课堂模式。  关键词: 翻转课堂 微视频 电子书包 MOOCs  翻转课堂(Flipping Classroom