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核酸(DNA或RNA)纯化是分子生物学下游实验和核酸水平临床检测的重要前提,纯化总体原则是高纯度核酸样品的获得和保证核酸结构的完整性。现有核酸纯化方法包括酚一氯仿抽提,高盐沉淀,离子交换和选择性吸附等。但方法存在不环保(使用有毒试剂),操作繁琐(多次离心),无法实现高通量(难以大规模自动化操作)等缺点。纳微米超顺磁性复合微粒,在核酸纯化方面体现出较大优势,与现有核酸纯化技术相比,无需离心,操作简便快速,能够实现高通量,自动化。国外已有以磁性复合微粒为载体纯化核酸的相关试剂盒产品,国内在此方面的研究与开发还较为落后。
本研究以我国自主知识产权的新型磁性复合微粒一金磁微粒为载体,建立了从大鼠肝脏纯化总核酸(即基因组DNA和总RNA)的方法。选择硫氰酸胍(Guanidin。Thiocyanate,GTC)裂解体系,将裂解后的样本与金磁微粒混合,总核酸将结合在金磁微粒表面,经过清洗后将吸附在金磁微粒表面的总核酸即可洗脱下来。纯化得到的总核酸在260 11111处有特征紫外吸收峰,凝胶电泳分析可见基因组DNA和28S RNA及18S RNA条带,其28S与18S RNA条带的比例约为2:1。建立的方法也适用于大鼠心、脾、肺、肾等组织的总核酸纯化。将该方法初步用于其它生物样本如细胞、细菌、植物、全血总核酸的纯化,同样获得较为理想的结果。
对建立的金磁微粒纯化总核酸的方法进行系统评价,结果表明:金磁微粒纯化核酸回收率为80%,方法的批内差从5.06%到16.29%,批间差从4.22%到20.5%,可稳定用于肝脏组织总核酸纯化。纯化得到总核酸作为模板用于B.action基因的RT-PCR反应,能够扩增出目的片段,说明总核酸样品纯度高,不含抑制RT-PCR.反应的抑制剂。
不经总核酸洗脱步骤,用DNase消化金磁微粒.总核酸复合物,可以得到总RNA。该方法能够从10 mg大鼠肝脏中纯化得到约40 lxg总RNA,OD260/OD280在2.0左右。纯化得到总RN.A能够应用于RT:PCR反应。同样,用RNase消化金磁微粒一总核酸复合物可以得到基因组DNA,从10 mg大鼠肝脏中纯化得到约5 pg的DNA,OD260/OD280为1.78。此外,制备共价偶联oligo(dT)20功能化磁性微粒,并以此为载体,从总核酸中纯化mRNA,凝胶电泳结果可见清晰弥散的mRNA,没有rRNA的污染,以纯化得到的。mRNA作RT-PCR反应,能够扩增出目的条带。综上所述,本研究建立了以金磁微粒从动物组织中纯化总核酸(包括基因组DNA和总RNA)的方法。在不洗脱总核酸的前提下,以DNase处理金磁微粒.总核酸复合物,经过进一步纯化,可以得到总RaNA,以RNase处理金磁微粒.总核酸复合物,经过进一步纯化,可以得到基因组DNA。以得到的总核酸为样品,可以用oligo(dT)偶联的磁性微粒进行mRNA的纯化。基于金磁微粒的核酸纯化方法可重复,操作简单,选择性好,纯化得到的DNA或RNA纯度高,收率高,是一种非常有前景的新方法。