利用噬菌体展示技术结合毛细管电泳迁移实验筛选并验证人GnRH启动子结合肽

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本文选取人GnRH基因的上游启动子片段(GP)作为受体靶分子,从噬菌体随机肽库中筛选GP的高亲和力配体,通过ELISA法分析了筛选结果,然后通过毛细管电泳迁移实验(CEMSA)验证阳性噬菌体与GP的特异性结合作用,最后利用生物信息学的方法分析了GnRH基因潜在的转录调控因子。 在亲和筛选过程中,分别以酶标板和磁珠作为固相载体固定GP分子进行噬菌体淘洗,ELISA比较两种筛选结果发现,利用酶标板筛选获得的噬菌体结合链亲和素的亲和力大于对GP的,而利用磁珠则富集得到阳性噬菌体,展示有GQPTPRNAGLPL(BM6),SRLNVEPLTTYS(BM3)和TTLHWASLTTGR(BM11)的噬菌体克隆被富集,DNA结合实验证明了长链DNA分子由于空间位阻太大而不能有效的固定在酶标板表面,因此不能用于大分子DNA的噬菌体筛选。 通过CEMSA分析筛选富集得到的噬菌体BM6、BM3和BM11与GP的结合情况,发现它们能特异性的与GP结合,而与其它无关的DNA片断不发生亲和作用,同时计算获得高亲和力的噬菌体BM6对GP的结合常数(Kd)为174.6±28.7nM。 通过测序获得噬菌体展示肽序列,生物信息学分析认为,GATA-4和AThookDNA结合模体这两种蛋白质是GnRH基因潜在转录因子。
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