环境问题是国家治理中的重要问题,损害赔偿则是这一问题的核心。《生态环境损害赔偿制度改革方案》的实施意味着我国对生态环境损害赔偿制度的探索进入了新的阶段。《改革方案》进一步强调了“主动磋商,司法保障”的工作原则,将生态环境损害赔偿磋商制度放到了整个赔偿制度体系的核心环节。但作为一项新制度,它在制度设计层面还存在诸多混沌不清之处,尤其反映在生态环境损害赔偿磋商的主体、程序和内容三个方面。实践经验表明,只有明确了磋商主体的范围才能有效落实生态环境损害修复责任,只有细化了磋商的程序才能高效运行磋商制度,只有厘清了磋商协议的内容才能有效开展磋商工作。对此,基于当下实务发展倒逼理论研究的现状,有必要在这三方面进行细化规制。本文在第一部分以生态环境损害赔偿磋商制度的发展为脉络,介绍了当下生态环境治理工作中这一制度的重要意义。继而在第二到四部分,分主体、程序和协议内容三个方面对生态环境损害赔偿磋商制度的相关内容进行了完善。首先,本文在第二部分对生态环境损害赔偿磋商的主体范围进行了规制,以此促使制度在程序上的顺利开展和在结果上的有效落实。即在赔偿权利人方面限定为省级和市地级政府,在赔偿义务人方面引入了生态环境损害共同侵权人、生态环境损害潜在责任人和生态环境损害责任强制险的保险公司,而在第三方主体方面则根据在磋商中的作用对其范围进行了细化规制。其次,本文在第三部分对生态环境损害赔偿磋商的程序进行了细化设计:分启动、实施和终结三个部分对磋商的程序进行了规划,并对生态环境损害赔偿协议的司法确认程序进行了完善。之后,本文在第四部分对生态环境损害赔偿磋商协议的内容进行了梳理,对协议中的重点:生态环境损害的事实、赔偿范围和责任履行方式进行了明确。最后,在第五部分本文以“绿益新非法倾倒案”为实践样本,依据现有理论分析了其中的亮点和不足,并建议依据实证完善生态环境损害赔偿磋商的相关法律体系和浙江省《磋商办法》。