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流感是巾流感病毒引起的具有高度传染性的呼吸系统疾病,流感病毒属于正黏病毒科,可分为A型,B型,C型。其中A型和B型流感病毒引起的季节性流感,发病率与死亡率高,造成的经济损失巨大,不断引发全球性健康问题。A型流感病毒报据病毒表面蛋白血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的抗原性,可分为17个HA和10个NA亚型,这些亚型的病毒组合几乎都可以从水生鸟类、家禽和其它禽类中分离到。A型流感病毒包含8个基因片段,至少编码14种以上的病毒蛋白。造成大流行的流感病毒常常是由两种毐株的不同RNA节段在感染细胞吋发生基因重排而产生的。流感病毒在理论上可以重组出现256(28)种不同基因型。为应对流感流行,己出现了多种快速、灵敏、准确的分子生物学检测技术。II前对流感核酸样品的检测,大多数是基于聚合酶链反应(PCR)、DNA测序及寡核苷酸微阵列等三种技术。测序可以提供详细的序列,大范围的基因背景信息,也可检测出未知微生物,但这种方法费时,需昂贵设备,仍需人工去除其无关的背景DNA序列;RT-PCR/PCR检测技术是一种非常快速和灵敏的检测方法,但在检测多种微生物或对多种亚型进行分型时,仍受通量限制;而DNA微阵列技术恰好弥补了PCR及DNA测序技术的不足,且有良好的敏感性和特异性,还可实现高通蛍。本研究计对当前A型流感病毒亚型多,高通量分型难等问题,应用低密度DNA微阵列分析技术,建立了流感病毒16种HA血清型鉴定方法。在NCBI流感病毒资源库中挑选出各亚型A型流感病毒代表序列,通过生物信息学方法分析16种亚型血凝素之间的同源关系,根据亚型间、亚型内的同源关系,确定探针的最佳长度,获得了每个亚型同--基因位点出现最多频率的…致序列,设计了18对PCR引物及108条用于分型鉴定的特异性寡核苷酸探针,实验筛选优选出54条探针。在此基础上,将18对PCR引物设计分为4组,建立分组多重PCR方法,扩增及标记靶基因。通过体外转录方法制备16种HA基因的病毒RNA,梯度稀释,进行敏感性试验。经数据分析,最终确定当相应有…条探针SNR532為2或信号强度F532Mean-B532^2000时判定为阳性,得出本研究的最低检测下限在100-1000个RNA拷贝,并具有很好的重复性。为验证DNA微阵列方法对新亚型流感病毒的检测性能,应用反向遗传操作技术拯救了重配H1N1、H4N6、H8N4、H9N1亚型流感病毒,并对其进行检测,结果表明,建立的检测方法可确定HI、H4、H8、H9等亚型反向遗传重配流感病毒株。应用本研究室自有毒株对DNA微阵列检测方法进行了敏感性、特异性试验,可特异性检测H1N1、H3N2、H9N2、H5N1亚型等18种毒株,最低检测下限为1X103EID5Q病毒滴度。幵展了流感分型DNA微阵列应急检测研究,成功回顾性检测了2004年吉林省白城市H5N1亚型高致性禽流感病毒阳性临床样品,并对2009年甲型H1N1流感病毒、季节性H1N1流感病毒和2013年H7N9亚型禽流感病毒进行区分鉴定,结果表明,研制的流感分型芯片可快速、特异并高通量筛查出不同亚型流感病毒,II在流感病毒应急防控中发挥了积极作用。上述建立的DNA微阵列检测方法,能够准确进行A型、B型流感病毒及H1-16种亚型的分型检测,实现了检测流感病毒分型及亚型的高通量、高特异性,简化了复杂病原的操作程序,显著缩短了吋间,为流感快速检测、监测和应急处置提供了一个快速、方便、准确的分子生物学诊断技术。