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云南是全球生物多样性最丰富的地区、世界稻种最大的遗传多样性中心之一及功能稻米的富集区。功能稻米是日常饮食中用量最大和饮食规律性最强的食品，挖掘利用云南稻核心种质的高功能成分种质，有助于功能稻米的选育和产业化，既对日常饮食预防慢性病意义重大，又对解决全球亚健康问题具有较高实用价值。
本论文以481份云南稻核心种质为材料，分析不同品种糙米四种功能成分(总生物碱、总黄酮、γ-氨基丁酸、抗性淀粉)含量的地理分布规律和生态特征以及不同栽培型间糙米功能成分含量差异，取得如下研究结果：
(1)糙米平均总生物碱含量为20.90mg／100g，总黄酮含量为232.26mg／100g，GABA含量为9.15mg／100g，抗性淀粉含量为1.29％；不同稻作区(稻作区分布见附图2)间糙米总生物碱含量差异不显著，而其它三种功能成分含量存在显著差异，糙米总生物碱含量为Ⅰ＞Ⅱ＞Ⅴ＞Ⅳ＞Ⅲ、糙米总黄酮为Ⅱ＞Ⅰ＞Ⅲ＞Ⅴ＞Ⅳ、糙米GABA为Ⅱ＞Ⅲ＞Ⅴ＞Ⅳ＞Ⅰ、糙米抗性淀粉为Ⅲ＞Ⅱ＞Ⅴ＞Ⅰ＞Ⅳ。
(2)来自于云南省16个州市的481份核心种质糙米功能总生物碱含量差异较大，依次为怒江＞红河＞丽江＞昆明＞大理＞曲靖＞西双版纳＞玉溪＞保山＞思茅＞德宏＞昭通＞文山＞临沧＞迪庆＞楚雄；糙米总黄酮含量依次为临沧＞楚雄＞文山＞玉溪＞思茅＞大理＞红河＞保山＞西双版纳＞曲靖＞德宏＞丽江＞怒江＞迪庆＞昭通＞昆明；糙米GABA含量依次为德宏＞迪庆＞文山＞思茅＞丽江＞临沧＞昆明＞西双版纳＞红河＞昭通＞怒江＞大理＞楚雄＞曲靖＞保山＞玉溪；糙米RS含量依次为德宏＞文山＞临沧＞红河＞西双版纳＞昭通＞思茅＞丽江＞玉溪＞迪庆＞曲靖＞昆明＞怒江＞大理＞保山＞楚雄。
(3)不同栽培型间糙米功能成分差异较大：糙米总生物碱含量以籼型、紫米相对较高；糙米总黄酮含量以粳型、陆稻、粘稻、早中稻和红米相对较高；糙米GABA含量以籼型、水稻、糯稻、晚稻和白米相对较高；糙米抗性淀粉含量以籼型、水稻、粘稻和晚稻相对较高。
(4)33对SSR引物在筛选出的功能成分高中低的116个品种中共扩增出146条多态性条带，每对引物的等位基因数变幅为2～7个，平均为4.42个。引物的PIC值变幅在0.137～0.816之间，平均为0.639;供试品种间的遗传相似系数变化范围在0.52～0.95之间。