浮游植物是食物网中占主导地位的初级生产者,其群落结构的变动将影响整个海域的生态系统,所以,研究浮游植物是研究海洋生态系统的基础。大亚湾海域海水水质优良、生物资源丰富且生态环境多样化,是中国南海东北部的一个重要海湾。但是,自二十世纪八十年代以来,随着大亚湾沿岸的工业、旅游业及海水养殖业的扩张,海港、交通和旅游业的建设同步发展,大量陆源污染物排入海水中,使得该海水水质受到严重的污染、呈富营养化;而且核电站温排水及全球气候变化使局部海域海水温度升高。二十世纪九十年代,该海域浮游植物的种类数显著下降,由此可见,沿岸的各项开发活动对该海域的生态系统造成了一定的负面影响。近年来,大亚湾区通过划定海洋生态红线区,建立环境治理机制,加强了对海洋生态系统的保护力度,海水水质得到了一定的改善。但该海区浮游植物的背景资料仍有待完善。本实验探究了 2017年11月至2018年7月,水质提升后的大亚湾及其邻近海域浮游植物群落结构的分布和季节性变化特征,希望能为大亚湾及其邻近海域的规划开发提供更加全面的生物生态背景资料。本研究的主要研究方法与结果如下:1.使用传统形态学的方式,鉴定2017年11月至2018年7月四个季节鲁哥氏碘液固定的海水样品中浮游植物的种类,分析每个季节中浮游植物的丰富度、丰度、优势种和多样性指数的水平和季节分布特征,并分析优势浮游植物和环境因子之间的关系。研究表明,大亚湾及其邻近海域浮游植物主要门类为硅藻,其次是甲藻。与历史记录比较,相较上世纪九十年代大亚湾核电站投产以来,本研究测得的浮游植物种类数明显增加,浮游植物丰富度恢复至1987年水平。四个季度都以硅藻为优势类群,浮游植物丰度夏季最高,单个站位最高丰度达到1.25× 109 cells/m3。优势种数量秋季最多,硅藻占比最高;冬季最低,同样是硅藻占比最高。生物多样性指数秋季最高,夏季最低。甲藻在四个季度中优势种数量及占比在春季最高,丰度在夏季最高。2.通过高通量测序的方式,鉴定2018年4月及7月的环境DNA样品。将物种注释后的浮游植物进行分类后与传统形态学鉴定结果进行比较,探究分析海水中浮游植物群落结构特征时,是否可以用高通量测序代替传统形态学鉴定。在本研究,高通量测序检测到了传统显微观察容易漏检的细胞直径较小、没有细胞壁的浮游植物,如隐藻。在分析浮游植物群落结构组成时,高通量测序和传统形态学都检测出主要的浮游植物类群。但是高通量测序受比对数据库物种信息不全的限制,有时无法将浮游植物精确鉴定到种的水平。所以,今后在研究海水中浮游植物群落结构特征时,应采用高通量测序和传统形态学鉴定相结合的方式。