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目的:动脉粥样硬化是一类由遗传与环境共同作用的复杂疾病。我们前期研究表明,免疫相关GTP酶家族成员IRGM在actin依赖性、CD36介导的ox-LDL摄取过程中起重要作用。在粥样斑块的周围,IRGM呈现高表达,而且ox-LDL可在体内外上调其表达水平。抑制IRGM可显著降低巨噬细胞对ox-LDL的摄取。因此,IRGM可能参与了血脂的代谢途径和动脉粥样硬化的分子调节途径。本研究探讨IRGM基因具有潜在生物学意义的单核苷酸多态性(Single nucleotidepolymorphism,SNP)位点与动脉粥样硬化疾病的发病风险及临床病理学特征间的相关性。 方法:查阅Hapmap数据库、相关流行病学调查数据报告等资料后,采用生物信息学手段选择IRGM基因中潜在功能性SNP位点作为研究目标。应用限制片段长度多态性聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction-restriction fragmentlength polymorphism,PCR-RFLP)技术对1246例哈尔滨医科大学附属二院心内科住院患者根据冠脉血管造影、血浆甘油三脂、总胆固醇、低密度脂蛋白等多项生物学特征进行了相关位点基因分型。利用Plink1.07、Haploview4.1等软件评估相关SNP位点基因型及等位基因频率分布在患者组和对照组之间的差异,计算优势比值(Odd ratio,OR)及95%可信区间(Confidence interval,CI),通过流行病学研究方法筛选与动脉粥样硬化易感性及临床病理特点密切相关的SNP位点。 结果:本研究选择检测的rs72553867、rs7705542、rs10051924位点最小等位基因分布频率(Minor allele frequency, MAF)均大于5%,且所有位点在对照组人群基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。rs7705542 GG基因型携带者血清总胆固醇水平(4.55±1.18)高于AG(4.41±1.07)和AA基因型(4.31±1.07)(P=0.038),rs10051924也与血清总胆固醇水平相关联(P=0.015)。另外,rs10051924也与炎症因子-血清超敏C反应蛋白(hs-CRP)相关(P=0.033)。采用Logistic多因素回归分析发现,校正年龄、性别、饮酒、抽烟、体重指数等协变量后,rs7705542与血清低密度脂蛋白升高(LDL>3.5mmol/L)呈显著相关(P=0.018)。rs10051924与总胆固醇水平升高(TC>5.72)(P=0.033)和低密度脂蛋白升高(LDL>3.5mmol/L)(P=0.026)均显著相关。重要的是,IRGM可能影响高脂血症患者对他汀治疗的效果。在他汀治疗的371名高脂血症患者中,rs10051924 TC携带者其LDL水平(2.52±0.97 mmol/L)显著低于TT(2.63±0.94 mmol/L) CC基因型携带者(3.03±1.61mmol/L)(P=0.009),同时也影响高密度脂蛋白HDL水平(P=0.04)。相反,在非他汀治疗的867名患者中,rs7705542和rs10051924与LDL水平均无关。 结论:IRGM基因的多态性与血清总胆固醇、低密度脂蛋白水平显著相关。其中rs7705542仅与血脂水平相关,而rs10051924不仅与其血清水平相关,而且与患者对他汀治疗的反应性相关。IRGM不仅与血脂有关,而且可与非遗传危险因素相互作用,显著影响冠状动脉粥样硬化和冠心病,甚至脑卒中的发生风险。这些结果说明,IRGM可能是一种新型的心脑血管疾病易感基因,可能通过调节血脂(尤其是LDL)代谢和动脉粥样硬化过程而发挥作用。