萍乡红鲫转铁蛋白研究

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萍乡红鲫(Pingxiang red-transparent crucian carp,Carassius auratus var.Pingxiangnesis)是江西省萍乡的一种野生鲫鱼突变种。经过七年的工作,已经完成了对其6代的选育。选育后的萍乡红鲫具有生长速度快、适应性强、营养价值高、易养易繁、抗病力强等优良经济性状,2008年被全国水产原、良种审定委员会审定为新品种。实验以萍乡红鲫的血清转铁蛋白(TF)为对象,通过电泳研究该鱼TF的表型、分子量等遗传性质;通过同源克隆得到该鱼TF-cDNA的序列,以期了解其遗传背景,为进一步的科学研究提供资料。本文的工作主要为:一、对萍乡红鲫的血清转铁蛋白(Transferrin,简称TF)进行电泳分析。聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)发现随机选取的12尾萍乡红鲫TF表型完全的相同,个体间没有差异;萍乡红鲫的TF表型为两个条带,推测可能由一个座位上的二个等位基因遗传决定。采用十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)对TF进行分析得出其分子量大约为71KDa。经人工选育的萍乡红鲫TF表型一致,种群内未见多样性,认为其遗传性状趋于稳定纯系;萍乡红鲫不同个体间完全_致的TF表型及分子量,可以利用TF雌核发育鉴定的遗传标记揭示萍乡红鲫具有雌核发育的生殖方式。二、为进一步了解了萍乡红鲫TF的分子机制,利用RT-PCR和RACE-PCR克隆出萍乡红鲫TF互补基因,克隆得到的TF-cDNA包含完整的开放阅读框(open reading frame,ORF),肉红鲫TF-cDNA长2364碱基对(base pair,bp),包括8bp的5′非编码区(untranslated region,UTR),355bp的3’UTR,编码666个氨基酸,理论信号肽切割位点位于15-16个氨基酸之间,预测的分子量为71.9,没有潜在的糖基化位点,还有34个半胱氨酸残基。结果分析表明萍乡红鲫TF遗传性质与彩鲫A、银鲫E同源性较高。最后对萍乡红鲫TF蛋白序列进行二级结构理论分析和三级结构的同源建模。
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