奶牛CXCR1及CXCR2基因多态性与乳腺炎相关性研究

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lvyuxuan36520091
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本研究采用巢氏PCR、DNA测序和CRS-PCR-RFLP方法,分析了中国荷斯坦牛、鲁西黄牛以及渤海黑牛的CXCR1&CXCR2基因编码区部分片段的遗传多态性,验证了CXCR1基因上已经发现的735(C/G),816(C/A),819(A/G)3个位点;发现了CXCR1基因上980(G/A)、995(G/A)和1008(C/T)3个新的SNPs位点和CXCR2基因上的938(C/T)、959(C/T)2个SNPs位点。其中735(C/G)、980(G/A)和995(G/A)3个位点的碱基突变分别引起了CXCR1基因编码的多肽第245位的Gln改变为His、327位的Arg改变为Lys、332位的Arg改变为His。群体遗传多态性检验发现,中国荷斯坦牛的8个位点均表现为中度多态(0.25<PIC<0.5),且群体的多态信息含量分布比较均匀;只有鲁西黄牛的995(G/A)位点表现为低度多态(PIC=0.2257)。Hardy-Weinberg平衡检验结果表明,中国荷斯坦牛在816(A/C),995(A/G)两个位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),说明这2个位点的突变受到漂变、选择或引种的影响,群体尚需进一步稳定。鲁西黄牛则在819(A/G),980(A/G)和959(C/T)位三个位点出现了不平衡(P<0.05)。渤海黑牛仅仅在959(C/T)位点表现不平衡(P<0.05)。对中国荷斯坦牛CXCR1&CXCR2基因多态性与体细胞评分相关性分析表明,CXCR1基因上的735(C/G),816(C/A),819(A/G)位点与奶牛体细胞评分密切相关,这与Youngerman等的结论一致。对CXCR1基因各位点基因型对应因素的比较发现,735(C/G)位中CC、CG基因型奶牛对应的SCS极显著低于GG基因型奶牛,305d产奶量分析,CC基因型奶牛的305d产奶量极显著高于GG基因型的奶牛。816(C/A)位点中的AC、CC基因型奶牛SCS极显著低于AA基因型奶牛,305d产奶量极显著高于AA基因型的奶牛。819(A/G)位点中GG基因型奶牛细胞评分极显著低于AG杂合型奶牛体。在CXCR2基因中938(C/T)位点中的CT、TT基因型奶牛SCS极显著的低于CC基因型奶牛,305d产奶量显著高于CC基因型个体。959(C/T)位点的CT基因型奶牛SCS极显著低于CC基因型奶牛,CT基因型奶牛的305d产奶量极显著高于CC和TT基因型。使用Phase软件作为单倍型频率的分析工具,对中国荷斯坦牛进行了单倍型预测,发现在CXCR1基因存在45种单倍型,CXCR2基因存在4种单倍型,两者结合预测到149种单倍型。
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