谷子和青狗尾草bZIP基因家族鉴定与谷子SibZIP8基因的功能研究

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干旱是影响粮食作物产量的主要逆境因素之一。谷子及其野生种青狗尾草抗旱耐瘠,是植物抗逆性研究的理想模型。bZIP转录因子在植物抵抗非生物胁迫方面发挥重要作用。bZIP转录因子在多种植物中已被鉴定,然而在谷子和青狗尾草中还未见相关报道。本研究利用生物信息学和分子生物学的方法,对谷子Setaria italica bZIP(SibZIP)和青狗尾草Setaria viridis bZIP(SvbZIP)的蛋白理化性质、染色体定位、同源性关系、基因结构、保守域等进行全面的分析,并利用转录组测序的数据对谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP基因的表达谱进行了分析,为后续功能研究提供信息。主要研究结果如下:(1)利用HMMER在全基因组水平共鉴定了90个谷子SibZIP基因和89个青狗尾草SvbZIP基因,参考之前模式植物拟南芥的命名方法,根据基因在染色体的位置,分别命名为SibZIP1-SibZIP90和SvbZIP1-SvbZIP89。另外通过构建谷子、青狗尾草、拟南芥和水稻的342条bZIP氨基酸序列的系统进化树,将谷子和青狗尾草bZIP基因各分成10个亚族,分别是A、B、C、D、E、F、G、H、I和S。其中A、D、G、I和S组包含基因数都多于平均基因数9。根据谷子根、茎、叶和穗子的转录组数据,对谷子SibZIP基因的组织特异性表达进行分析。结果表明谷子SibZIP基因的组织特异性比较强,每个基因至少在一种器官中都有表达。利用GEO数据库中青狗尾草的胚芽(Col)、嫩芽(Sprout)、第三叶叶尖(TTL)、第三叶中部(MTL)、第三叶基部(BTL)、叶分生组织(LM)、花序分生组织(If)、开花前花序(YF)、开花后花序(OF)和根(Root)10组转录组数据,对青狗尾草10个亚族中SvbZIP基因在不同的组织器官和发育阶段的表达情况进行了详细的分析。(2)本研究对谷子SibZIP8基因的功能进行了转基因验证,发现SibZIP8过量表达的转基因拟南芥在盐胁迫下,萌发率高于野生型。而且转基因拟南芥植株,在干旱胁迫又复水后的存活率和抗旱性都高于野生型植株,说明过表达SibZIP8基因确实能提高拟南芥的抗旱性。该研究结果为全面解析谷子抗旱的分子机制提供新信息,为植物抗旱分子育种提供基因资源。
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