现有研究表明我国高校控股上市公司业绩表现不够理想,甚至低于市场平均水平,公司内部治理是提高企业经营绩效的良方,本文从公司内部治理的股权结构入手研究其与企业绩效的关系。高校的教职工在高校控股上市公司高管层中占据了重要组成,来自高校的高管在校内丰富的技术或管理经验是否对其经营管理公司有益呢?高校控股上市公司作为高科技公司,其研发投入产出绩效如何呢?国内多名学者研究认为我国高校控股上市公司业绩表现差的原因之一是因采用多元化经营而缺乏核心竞争力。股权结构是否会通过影响高管特征、研发投入决策和多元化经营来影响企业绩效?基于以上疑问,本文从高管特征、研发投入和多元化经营三个角度研究了股权结构与与企业经营绩效的关系。本文基于我国A股市场的24家高校控股上市公司2005年至2013年的数据并选取了同行对照公司样本进行了实证分析,得出以下结论：(1)高校控股上市公司增大股权集中度对企业绩效促进作用较弱,而其他大股东对高校这一第一大股东的制衡程度的提高能显著提升企业绩效(2)董事长由来自高校的人员担任企业有更好的绩效,高管货币薪酬有一定的激励作用,股权结构影响高管特征与企业绩效的关系。(3)研发资金投入转化为企业绩效能力欠佳,研发人员的投入越多,公司业绩表现越好,股权结构影响二者的关系。(4)高校控股上市公司多元化经营降低了公司绩效,股权制衡的提高能提升多元化经营绩效。