基于filter和ICA的LDA算法在微阵列数据中的应用

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DNA微阵列数据广泛应用于生物医学,特别是癌症方面的研究。它是典型的高维小样本数据,具有高维,高冗余,高噪声的特点,许多经典的处理算法无法直接应用。线性判别分析(LDA)是模式识别的经典方法之一,在模式识别、数据分析等诸多领域取得了良好的应用效果。本文在分析和总结现有的LDA算法的基础上,将LDA应用于微阵列数据,取得了较好的结果。本文主要做了以下两方面工作:第一,分析总结了LDA算法在微阵列数据中的应用,提出了一种基于filter法则和ICA变换的LDA算法—FILDA算法。与传统的LDA算法处理微阵列数据相比,该算法消耗时间较少,且有效避免了矩阵变换奇异问题的产生,同时去除了特征中的冗余和噪音,提高了分类正确率。通过在Brain,Colondata,Prostate等微阵列数据集上的实验,以及同其他方法的对比实验,表明了本文算法的有效性。第二,由于独立分量分析具有计算不稳定性,本文借鉴了集成学习的思想设计了一种基于FILDA算法的集成系统,并进行了实验研究。实验结果表明,该系统在提高数据分类正确率的同时,具有较好的稳定性。DNA微阵列技术已经在医学以及生物学上得到越来越广泛的应用,其分类识别问题也是热点问题,本文即是对此的一个有益尝试。
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