药用皇菊CmACO和CmDA1基因的同源克隆

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药用菊花为菊科植物菊(Chrysanthemum morifolium Ramat.)的干燥头状花序,是我国传统中药材和保健茶饮之一,其活性成分主要包含挥发油、黄酮、绿原酸、微量元素等,具有极高的饮用、药用及观赏价值。1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶(ACO)是催化乙烯生物合成途径最后一步的关键酶,控制着乙烯的生成速率。DA1基因编码一种泛素受体,是植物中重要的细胞增殖调节因子,在拟南芥中DA1基因对种子和器官大小起负调节作用。本研究以皇菊为材料,优化了皇菊的再生和遗传转化体系,克隆了皇菊中的CmACO和CmDA1基因并对CmACO和CmDA1基因进行了生物信息学分析,为进一步开展CmACO和CmDA1基因功能研究提供了便利,同时也为药用皇菊的分子育种研究奠定了理论基础。主要研究结果如下:1.对药用皇菊的再生体系进行了优化,获得的最优的诱导药用皇菊叶盘分化出芽的条件为MS+6-BA 1 mg/L+NAA 0.5 mg/L,最优的诱导药用皇菊小苗生根的条件为1/2MS+NAA 0.1 mg/L。2.对药用皇菊的遗传转化条件进行了优化,并结合最优的皇菊再生条件获得了最优的遗传转化体系为:预培养3天,以OD600=0.50.6的菌液侵染叶盘12 min,共培养3天,脱羧7天,之后转入筛选培养基(MS+6-BA 1 mg/L+NAA 0.5 mg/L+Kan 8mg/L+Carb 300 mg/L),两周继代一次,进行不定芽筛选,待抗性不定芽长至23 cm时即可转入生根筛选培养基(1/2MS+NAA 0.1 mg/L+Kan 8 mg/L+Carb 300 mg/L),进行生根筛选。3.利用同源克隆和RACE技术从药用皇菊中分别克隆得到一条1196 bp的ACO基因序列和一条1950 bp的DA1基因序列,分别命名为CmACO和CmDA1。利用在线网站ORF finder预测出CmACO和CmDA1的全长开放阅读框(ORF)分别为942 bp和1542 bp,分别编码313个氨基酸和513个氨基酸。对全长ORF所编码的氨基酸序列进行Smart BLAST分析,表明从皇菊中克隆所获得的CmACO和CmDA1基因的氨基酸序列与其它物种中的ACO和DA1基因的氨基酸序列具有很高的同源性,说明CmACO和CmDA1基因都具有与它们活性相关的重要和典型结构域。对CmACO和CmDA1的基因组序列进行分析发现CmACO包含4个外显子和3个内含子,CmDA1包含12个外显子和11个内含子。4.进化树分析的结果显示从药用皇菊中克隆所得的CmACO基因的氨基酸序列与青蒿中ACO基因的氨基酸序列相似度最高,进化关系最为接近;CmDA1基因的氨基酸序列与除虫菊和青蒿中DA1基因的氨基酸序列相似度最高,进化关系最为接近。由此可初步确认本研究所克隆的CmACO和CmDA1基因分别为药用皇菊中编码ACO蛋白的基因和编码DA1蛋白的基因。
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