应用SSR标记分析黄绿蜜环菌种群遗传结构

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黄绿蜜环菌(Armillaria luteo-virens),隶属口蘑科(Tricholomataceae)蜜环菌属[Armillaria(Fr.: Fr.) Staude],主要分布在我国的青海、西藏等地海拔3000-4500m的草原或高山草甸上,具有较高的食药用价值和生态功能,是青藏高原珍贵真菌资源宝库中典型代表种之一。本研究利用SSR分子标记方法对青海、西藏及四川的22个黄绿蜜环菌野生群体的种群遗传结构以及遗传多样性进行研究。主要研究结果如下:1、应用L16(45)正交试验设计建立并优化了黄绿蜜环菌SSR-PCR反应体系,其最适反应体系为15μL,其中包括:即在15μL反应体系中包括:1×PCR Buffer,100ng模板DNA,dNTPs217μmol/L,primer0.5μmol/L,Taq DNA聚合酶0.75U,Mg2+1.3mmol/L。反应程序为:94℃5min;94℃30s,Ta℃30s,72℃1min,35个循环;72℃10min。2、应用上述优化体系对近缘物种的SSR引物进行筛选,共获得8对具有较丰富的多态性的引物,并确定了每对引物PCR扩增的最适退火温度,筛选出的8(占有效扩增的57.1%)对核心SSR引物适用于黄绿蜜环菌群体遗传学特征分析。3、本研究利用7个微卫星标记对黄绿蜜环菌个体进行遗传多样性和遗传结构分析,共检测出38个等位基因,He在0.217-0.675之间,PIC为0.4226,7对微卫星引物具有较高多态性;7个标记对22个黄绿蜜环菌种群的Nei基因多样性指数(H)范围为0.265-0.465,表现出较高遗传多样性。4、聚类分析结果表明,22个黄绿蜜环菌种群可分为三个显著的地理种群,除G(刚察)种群之外,其余种群都是地理位置相近的聚在一起。黄绿蜜环菌22个种群的变异主要来源于种群间,其中ФCT=0.1924,ФSC=0.1277,种群间分化较大(ФST=0.4319),种群间基因交流受到一定限制。
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