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近年来随着城市化进程的加快以及城市人口的不断增长,人们对于日化用品的需求量也在不断增加,从而导致城镇污水处理厂的负荷越来越大,因此越来越多的污染物由于不能被污水处理厂处理而进入水体从而导致一系列的水体健康问题。目前对污水处理厂排水的水质评价主要依靠现有的物理化学指标对污染物进行定性定量分析或者研究某一类污染物对水体中少数几种水生动植物的生态效应。这种现有的评价方法并不能反映出污水处理厂排水中多种污染物对水体的复合影响。本文选取三条不同受纳水体中着生生物膜及浮游微生物群落作为观察目标通过高通量测序技术对样品DNA进行分析,通过研究水体中微生物群落的组成及分布来深入研究污水处理厂排水对受纳水体微生物群落产生的影响。通过对受纳水体各点位常规理化性质进行测定发现污水处理厂排水中TN、TP及CODcr等指标均高于受纳水体上游,这表明污水处理厂排水会提高受纳水体中水体富营养化的风险,从而影响水体生态功能;并且排水口处pH值明显低于水体上游,这是由于污水处理厂处理工艺造成的;受纳水体中TN及NO3--N的浓度具有季节性变化,水温越高其浓度越低。对受纳水体微生物群落进行ANOSIM分析发现:着生生物膜的群落结构与浮游微生物的群落结构具有显著差异（R>0.716,P=0.001）,其中着生生物膜中优势门类为蓝藻门,而浮游微生物群落中优势门类为变形菌门,这可能是由于细菌的黏附作用导致的。同时发现水体中浮游微生物群落对于水体变化十分敏感,因此可以通过观察浮游微生物的群落组成来指示水体的瞬时变化,而着生生物膜群落由于构成复杂可以用来指示水体的长期变化。进一步对受纳水体微生物群落生物信息和水体理化指标数据进行RDA分析,发现水体中微生物群落具有显著的季节性差异（R>0.435）与空间位置差异（R>0.511）,其中季节性差异主要是由于温度造成的,并且TN、NO3--N等指标也会造成水体微生物群落的季节性差异,而空间位置差异主要是由于污水处理厂排水导致上下游水体理化性质改变造成的,如pH、TP等指标。通过对受纳水体中着生生物膜及浮游微生物群落结构以及受纳水体的理化性质进行分析研究可以更加全面的反映出污水处理厂排水对水体造成的复合生态效应,同时可以准确发现对微生物群落变化起到重要作用的环境因素,为全面评价污水处理厂排水对受纳水体微生物群落造成的影响提供技术支持和参考。