农村宅基地流转与农民利益保护息息相关,由于当前农村宅基地流转的限制过多,导致农民权利要求难以得到充分满足,甚至农民的自有房屋也无法流转,或者只能在本集体经济组织内部有限地流转。这些现状无法适应农民权利需求高涨、城市化进程不断深入的社会背景,因而必须对现有的关于农村宅基地流转的法律制度进行改革。本文以农村宅基地流转中农民权益的法律保护为研究对象,就农村宅基地流转中的相关法律问题尤其是农民权益保障的问题展开了深入的研究,主要包括如下研究内容：第一部分是绪论,绪论部分主要介绍了本文的研究背景、文献综述、方法与思路、观点与创新等,是全文研究工作的起点；第二部分是农村宅基地流转的立法与实践现状,本部分首先分析了当前与农村宅基地流转相关的法律法规、政策文件,如物权法、土地管理法等,认为当前农村宅基地流转中现行法律法规对农村宅基地流转设置了过于苛刻的条件,其目的是为了保障农村集体土地制度的稳定。但是在实践中,小产权房现象比较流行,宅基地地下交易较为普遍,这些交易都以“灰色交易”的方式得以存在；第三部分是限制宅基地流转对农民权益的影响。本部分主要就农村宅基地流转中农民权利保障不足的现象进行了分析,认为由于农村宅基地流转的限制性条件过多导致农民的财产权没有得到充分的尊重,以至于农村宅基地和农村房屋大量荒废,不能实现物尽其用和鼓励交易,无法促进社会财富的创造,甚至连宅基地的基本福利性质也无法得到体现；第四部分是农村宅基地流转中农民权利保障不足的成因。本部分试图探讨农村宅基地流转中农民权利保障不足的具体原因,并从立法、观念、利益三个角度分析了农村宅基地流转会受到严格限制,导致农民权益无法得到切实保障的成因,认为立法上的限制是直接原因,观念上的一些认识误区也造成了农村宅基地流转中农民权益保护不足,而利益层面的冲突则是根本原因,即农村宅基地流转并非一种简单的产权交易,而是涉及多方主体之间的利益博弈；最后一部分是农村宅基地流转与加强农民权利保障的建议。本部分主要从总体思路和具体对策两个方面探讨了应如何构建农村宅基地流转的制度,使农村宅基地流转规范化、合法化,并使农民权益在此过程中得到充分的保障,在具体的措施上包括扩大宅基地流转的交易对象范围,建立农村宅基地流转市场,合理分配不同主体之间的宅基地流转收益等。