我国产业目前正处于全面转型升级的重要阶段,大部分劳动密集型企业急需快速向资本与技术密集型企业转型升级,科技创新在其中发挥着举足轻重的作用。而科技创新活动具有成本大、风险高、滞后性与外部性强等特点,使得企业创新动力通常不足,需要政府实施补贴、税收优惠等一系列政策支持。但是近年来,部分企业获得政府补贴后并未有效促进其创新绩效提高,反而可能恶化大股东侵占公司利益的现象,激化股东与管理层的矛盾,降低企业的创新绩效,甚至导致一部分企业编造研发项目,骗取政府补贴的不良现象,其中企业的治理结构出现问题是很重要的一个原因。因此,从公司治理角度出发,深入探讨政府补贴和公司创新绩效的关系,和不同治理要素对两者关系的调节作用,对完善上市公司的治理结构、促进政府补贴发挥最佳效用具有重要意义。本研究运用了理论研究和实证研究的方法,通过以利益相关者理论、市场失灵与外部性理论、信息不对称理论以及委托代理理论为基础,分析政府补贴和公司创新绩效的机理关系,以及公司治理要素中的股权集中度、独立董事、管理层激励包括高管薪酬激励和股权激励,对政府补贴和创新绩效关系的调节效应,并构建了相应的计量经济学模型。利用上市公司的经济数据作为研究样本,验证研究假设,并得出了研究结论。研究发现,政府补贴与公司创新绩效具有显著正相关性,对于公司治理要素对两者关系的影响,实证分析表明股权集中度对政府补贴和公司创新绩效之间的关系具有负向调节作用;独立董事占比对政府补贴和公司创新绩效的关系具有显著的促进作用;而高管薪酬激励对政府补贴和公司创新绩效的调节作用并不显著;提高高管股权激励程度,则会提高政府补贴对公司创新绩效的积极影响。