单增李斯特菌（Listeria monocytogenes）是一种重要的食源性致病菌,为食品病原菌致死率最高的一种,广泛分布于自然环境中,可引起免疫力低下群体感染,引起脑膜炎、败血症、流产及中枢神经症状等临床病理变化。牛羊作为天然宿主,可将单增李斯特菌传播到相关的肉和乳产品中。目前我国对牛羊养殖及食品链中流行背景与传播规律尚未明晰,因此,调查我国牛羊主产区单增李斯特菌在牛羊养殖及食品链中的流行情况,阐明该菌在其中的传播规律对食品安全防控至关重要。1.采集中国牛羊主产区的养殖场、屠宰场和市场零售环境中各环节采集大量样品,进行常规的细菌分离鉴定,根据李斯特菌在各环节各类样品中的分离率和地理环境等因素,结合SPSS统计分析,进行初步的流行病学分析。发现环境及饲草的干燥程度,可能对养殖环节部分地区李斯特菌的分离率低有关,屠宰环节和市场流通环节是控制李斯特菌在牛羊养殖及食品链中流行与传播风险的关键环节。2.对分离出的菌株进行表型和基因型特征的分析,结果发现在牛羊养殖环节和屠宰环节分离到的单增李斯特菌包括1/2a、1/2c血清型;在市场流通环节,分离到的菌株包括1/2a,1/2b,1/2c,4b,7血清型;在牛羊养殖、屠宰环节中发现的单增李斯特菌序列型ST7、ST9、ST91和ST155和市场流通环节发现的序列型ST2,ST9,ST87,ST101,ST121,ST155,ST307,ST619与我国人间李斯特菌病发病率具有关联性。此外,在牛羊养殖及食品链中单增李斯特菌存在着与人类李斯特菌病的发病机制密切相关的高致病性毒力标志物（LIPI-3、LIPI-4和ECIII）,且存在着多重耐药现象;本研究中英诺克李斯特菌呈现绝对的流行优势,部分英诺克李斯特菌株被发现存在着毒力岛3,4上的毒力基因,小鼠毒力实验,显示致死性,以上结果均预示着潜在的公共卫生风险,具有一定的公共卫生意义。3.对部分代表性分离株开展脉冲场凝胶电泳（PFGE）研究,发现不同类型的样本中可发现完全相同的菌株,为探究单增李斯特菌的传播途径与传播规律提供了强有力的分子依据和理论数据。结果表明,李斯特菌可以沿着屠宰链从养殖环节进入屠宰环节,向终末肉产品传播,特别是对牛屠宰场样本的定量分析结果显示污染程度逐级加深,污染与流行贯穿于整个食品链中。4.全基因组测序后开展的基于核心基因组的多位点序列分型、单核苷酸多态性进化分析也证明了以上污染路径,菌株可以从养殖环节进入屠宰环节,菌株可能经牛群转移/饲草转移/候鸟迁徙/肉食品跨地域流通等方式跨地区传播。本研究阐释了单增李斯特菌在我国牛羊主产区牛羊养殖及食品链中流行与传播规律,涉及地理广阔,样本及获得的分离菌株数量大,代表性好,分析研究系统,所得数据客观,填补了我国牛羊养殖及食品链中李斯特菌的流行病学背景方面的相关空白,为我国人与动物李斯特菌病的防控实践操作、国家食品安全标准制定以及相关的科学研究提供了科学依据。