太湖流域位于长三角重要的经济区,对于沿湖流域地区企业的经济发展以及当地居民的生产生活具有重大意义。多年来,太湖的污染治理一直是国家重点关注的问题。然而由于湖泊特殊的地形特征,污染的治理成效并不明显。因此,太湖流域的污染治理,必须从流域的全局出发,建立生态补偿制度。目前改善水质状况的生态补偿,大都是单向补偿。即当上游地区的超标排污行为给下游地区带来损害时,由上游地区对加重下游治污负担的行为进行补偿。然而,河流之间的上下游关系比较复杂,单向补偿考虑的问题比较片面。当上游地区为污染治理做出了积极贡献,提供了优于交界断面标准的水质时,下游地区的治污负担减轻了,应该对上游做出的贡献进行补偿。本文分析了太湖流域的现状,从生态补偿的理论出发,明确了双向生态补偿的基本概念。结合目前江苏省的生态补偿实践,对在江苏省内建立水质双向生态补偿机制提出了建议。希望通过完善法律制度,补偿标准,补偿方式,以及建立政府的管理模式和公众参与等方式,构建江苏省内的水质双向生态补偿机制。通过上下游的沟通协商,在整个流域内开展双向生态补偿,能够调动各方的积极性,尽快改善太湖水质,恢复太湖生态。