【摘 要】
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结合染色质的读体蛋白对组蛋白翻译后修饰的识别是表观遗传调控的一个主要机制。细胞核抗原Sp100(斑点状、分子量为100 kDa的蛋白)是早幼粒细胞性白血病核体(PML-NB)的组成型成分,在固有免疫及转录抑制中发挥重要作用。其剪接亚型Sp100C的羧基端具有独特的植物同型结构域锌指(PHD)和溴区结构域(Bromo)串联模块(Sp100CPB),且可以被干扰素刺激特异性的上调。运用结构生物学、定量
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结合染色质的读体蛋白对组蛋白翻译后修饰的识别是表观遗传调控的一个主要机制。细胞核抗原Sp100(斑点状、分子量为100 kDa的蛋白)是早幼粒细胞性白血病核体(PML-NB)的组成型成分,在固有免疫及转录抑制中发挥重要作用。其剪接亚型Sp100C的羧基端具有独特的植物同型结构域锌指(PHD)和溴区结构域(Bromo)串联模块(Sp100CPB),且可以被干扰素刺激特异性的上调。运用结构生物学、定量结合实验及细胞共定位分析的方法,我们揭示Sp100C的PHD结构域不仅可以识别组蛋白H3第4位赖氨酸非甲基化状态(H3K4me0),还可以容忍组蛋白H3第3位苏氨酸的磷酸化(H3T3ph)、第9位赖氨酸的三甲基化(H3K9me3)及第10位丝氨酸的磷酸化(H3S10ph)。这些修饰类型都与细胞分裂期染色体相关,我们的实验也表明Sp100C可通过对组蛋白的识别调控细胞周期。与之对比,旁系同源蛋白Sp140的PHD结构域也可以识别H3K4me0,但丧失了对H3T3ph、H3K9me3、H3S10ph的容忍能力。Sp100CPB-H3K4me0复合物晶体结构表明,Sp100C延伸的氨基端可形成高度协调的“配位层”类似结构来识别H3K4的ε-氨基,且二硫键固化后的口袋对H3K4me0的识别增强。Sp100CPB-H3T3ph复合物晶体结构表明,H3T3ph的识别是通过Sp100C的PHD结构域特有的精氨酸实现的。本研究揭示出Sp100C有直接靶向染色质的能力,并可能通过这种方式响应干扰素刺激,在PML-NB介导的固有免疫和基因沉默中发挥限制性作用。而细胞质内的微管骨架上也存在着类似的微管蛋白密码。目前唯一位于微管腹腔一侧的翻译后修饰是α微管蛋白第40位赖氨酸的乙酰化(K40ac),由物种间高度保守的酶αTAT1催化,但其催化反应的分子机制尚不清楚。在本文中,我们解析了鼠αTAT1催化结构域和辅因子乙酰辅酶A(AcCoA)复合物的晶体结构。除了采用GNAT乙酰基转移酶超家族核心结构域相似的折叠外,αTAT1具有额外的底物识别相关的β4/β5插入片段、独特的正电荷区及必需的氨基端疏水区。AcCoA腺苷部分被αTAT1残基侧链以特殊的“三明治”构型紧紧结合在核心结构域中央沟槽内。αTAT1的催化活性依赖于K40所在区域的环形构象及微管原丝间的侧向相互作用。电镜实验表明αTAT1除结合K40位点外,还可能有位于微管外侧的结合位点。本研究阐释了αTAT1的结构特征,为进一步探讨αTAT1与微管识别模式及其对微管相关生命活动的调控作用提供了重要依据。
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