玉米灰斑病是由玉蜀黍尾孢菌引起的世界性病害,主要发生在玉米的叶片、叶鞘和苞叶上。玉米对灰斑病的抗性属于数量性状,本研究进行玉米抗灰斑病QTL分析,目的是找到与抗病基因紧密相连锁的分子标记,从而开展分子标记辅助选择,提高育种效率,为大规模培育优良品系或品种提供依据。本研究采用玉米高抗灰斑病自交系T32和高感灰斑病自交系J51为亲本组配所得的F2代为作图群体,构建SSR标记遗传连锁图谱,F2:3家系种植在云南省德宏州芒市灰斑病高发区勐嘎镇和江东乡两个环境,主要研究结果如下:1.以高抗灰斑病自交系T32为母本,高感灰斑病自交系J51为父本,构建了189个F2株系为作图群体。根据MaizeGDB信息,选取了880对覆盖玉米全基因组的SSR引物对两亲本进行多态性筛选,筛选出137对多态性引物,多态性比例为15.6%。本研究对筛选出来的多态性引物增加F1的DNA结合IBM参考图谱做进一步筛选,其中剔除表现为显性、扩增不稳定和差异小、难以分辨的标记后,选择可以在群体中扩增出稳定清晰的条带共89个标记最终进入连锁图谱的构建。2.利用Join map version 3.0作图软件,对89对多态性引物进行连锁分析,构建了F2群体遗传连锁图含12个连锁群,其中第4和第8染色体被分成了两个连锁群,所构建的连锁图共拟合了86个SSR位点,总的遗传距离为828.369 cM,标记间的平均距离为9.62 cM。大部分标记与标准图谱IBM2 2008 Neighbors Frame6(http://www.maizegdb.org)上的位置较一致,符合QTL初步分析。3.189个F2:3家系种植于云南省德宏州勐嘎镇勐嘎村和江东乡李子坪村两个环境,每个试验点种植两次重复,田间自然发病。根据我国叶斑病调查标准,在乳熟期调查F2:3家系田间自然发病情况。田间表型鉴定结果表明:在江东和勐嘎两个试验点,抗病亲本T32均表现一致高抗(1级),感病亲本J51均表现一致高感(9级),F1表现一致抗病(平均病级勐嘎为2.3级、江东为3.3级),F2:3家系则表现明显抗感分离。用SPSS20.0对F2:3群体189个家系的平均病级进行正态分布检验,从偏度和峰度两个参数来看(绝对值小于1),没有明显偏离正态分布,符合QTL定位的基本要求。性状分布图表现连续分布,显示抗病性可能是由多基因控制的数量性状;分布图有明显的峰,表明可能有主效QTL控制该性状。4.采用完备区间作图法对两个试验点的F2:3家系的病级调查结果进行灰斑病抗性QTL检测和基因效应分析,在江东点共检测到3个抗性的QTLs,分别位于第4和第8染色体,其中第4染色上共检测到了2个QTLs,加性效应分别为-0.3656、-0.7086、-0.2171,均来自于亲本T32,分别解释了7.0047%、22.0517%、7.368%的表型变异。在勐嘎点共检测到了6个QTLs,分别位于第1、2、4、7和第8染色体上。在勐嘎点检测到的6个QTLs中,其中在第1染色体位置为139.00的QTL和第2染色体上的QTL加性效应来自亲本J51,效应值分别为0.3123、0.3500,贡献率分别为5.0219%、7.8178%;其余的4个QTLs的加性效应均来自亲本T32,效应值为:-0.2422、-0.2790、-0.3779、-0.5657,可分别解释4.2467%、3.9767%、6.8053%、12.9815%的表型变异。5.对江东和勐嘎两个试验点的田间鉴定结果进行联合QTL分析,检测到1个在两个环境中同时表达的QTL,位于第8染色体上的标记umc1130-umc2354之间,图谱上的位置是:10.00;在江东和勐嘎两点的LOD值分别为:3.3135和5.9711;分别能解释抗玉米灰斑病7.3680%和12.9815%的表型变异,加性效应均来自于母本T32。该QTL可以作为玉米抗灰斑病分子标记辅助选择的候选染色体区段,为玉米抗灰斑病的遗传机制深入研究提供理论参考。根据QTL遗传效应分析结果可知:基因作用方式以部分显性效应和加性效应为主,但同时也存在显性效应和超显性效应的作用方式。