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偃麦草属（Elytriga）的长穗偃麦草（Et.elongata，2n=10x=70）和中间偃麦草（Et.intermedia，2n=6x=42）是普通小麦（Triticum aestivum，2n=6x=42）的两个重要的野生近缘种，具有抗白粉病、锈病、赤霉病、黄矮病等多种抗病基因，还具有抗寒、抗旱、耐盐碱和高籽粒蛋白含量等优异性状。通过染色体工程方法创制小麦-长穗偃麦草和小麦-中间偃麦草的异附加系、异代换系和易位系等染色体工程材料，进而挖掘和利用其优异基因，对于丰富普通小麦的遗传多样性和品种改良具有重要的意义。 本文利用不同背景的优良小麦品种与小偃麦双二倍体杂交，创制了一批偃麦草染色体的附加系、代换系、易位系等分子染色体工程基础材料。通过荧光原位杂交(FISH)和SNP分子标记对其染色体组成进行了分析，并重点调查其抗病性等重要农艺性状。进一步利用优良的小麦品种与鉴定到的抗病材料杂交，培育抗性、产量等重要性状优异的育种材料，同时利用小麦SNP芯片技术对来自于偃麦草的抗病基因进行了初步染色体定位。获得的主要结果如下: (1)以4个八倍体小偃麦（小偃693、小偃784、小偃7631和小偃78829）与11个普通小麦品种杂交后自交获得的F2为原始材料，通过自交或与不同优良小麦品种进行杂交和回交创制了F8、BC1F6、BC2F6和BC1F7代群体材料。分别以长穗偃麦草和中间偃麦草基因组DNA为探针对其中的4355个株系进行了GISH鉴定，共获得有外源染色体成分的材料209份，包括121份易位系、32份代换系和56份附加系。其中来自于长穗偃麦草的材料有134份，包括49份易位系、32份代换系和53份附加系;来自于中间偃麦草的材料有75份，包括72份易位系和3份附加系。 (2)利用GISH-FISH鉴定技术，对44份小麦-长穗偃麦易位系和30份代换系材料中参与易位和代换的小麦染色体进行了分析，其中参与易位的小麦染色体主要集中在4DL、4DS和5AS的端部，被代换的小麦染色体主要是4D和6B染色体。 (3)利用42对E基因组特异的SNP标记对49份小麦-长穗偃麦草易位系、32份小麦-长穗偃麦草代换系和46份小麦-长穗偃麦附加系中的长穗偃麦草染色体进行了高分辨率熔解曲线（HRM）分析。易位系材料中，有28份易位系材料的易位染色体片段来自于4EL，1份易位系材料的易位片段来自于6ES，2份易位系材料的易位片段来自于6EL，2份材料的易位片段来自于3ES。代换系材料中，6份为6E代换系、12份包含6ES、7份为2ES-6ES重组染色体代换系、4份材料为1EL-6ES重组染色体代换系。附加系材料中，18份材料为6E附加系，9份为2ES-6ES重组染色体附加系，2份为2ES-6E重组染色体，1份材料包含2ES的染色体成分，12份材料包含6ES的染色体成分，1份材料的附加染色体为E组和St组重组染色体。 (4)对获得的染色体工程材料及F8、BC1F7和BC2F6代部分株系进行了苗期抗条锈病(小种CYR32、CYR33和V26)和白粉病（菌系E18）鉴定，共得到21份高抗白粉病的材料（包括2份纯合端部易位系）、83份高抗条锈菌的材料（包括8份易位系、10份代换系和3份附加系）和25份兼抗条锈病和白粉病的材料（其中4份具有全生育期条锈病抗性、3份具有赤霉病抗性）。 (5)对7320个BC1F7、BC2F6和F8代株系和1200个BC1F8、BC2F7和F9进行了10个重要农艺性状的调查（2015年和2016年），获得了218个综合农艺性状优良的株系，其中有40份材料具有全生育期条锈病抗性、2份具有赤霉病抗性。同时重点考察了25个兼抗条锈病和白粉病株系的12个主要农艺性状，这些株系的综合农艺性状均较优良，其中5个株系的千粒重显著高于对照亲本，P3014和P5697两个株系除了千粒重性状外，在其它产量性状上也显著优于5个主栽品种;且其中3个株系在成株期也表现为抗病。 (6)选择了6个兼抗条锈病和白粉病的材料，分别与3个性状优良且同时感条锈和白粉的小麦品种进行了杂交，获得了F1代种子。对F1代进行了苗期抗条锈病鉴定，结果显示6个F1代材料均表现为对强毒性新小种V26免疫或近免疫，证明该抗条锈病基因为显性基因，且其中3个组合的F2群体中抗感株比符合3∶1，说明抗病基因为单显性基因。